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Caractérisation de la différenciation in vitro des kératinocytes primaires humains par analyse ARN-Seq

Journal JoVE
Génétique

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Characterization of In Vitro Differentiation of Human Primary Keratinocytes by RNA-Seq Analysis

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Caractérisation de la différenciation in vitro des kératinocytes primaires humains par analyse ARN-Seq

DOI:

10.3791/60905-v

•

07:29 min

•

May 16, 2020

•

Jos G.A. Smits*¹, Jieqiong Qu*¹, Hanna Niehues, Huiqing Zhou³

¹Department of Molecular Developmental Biology, Faculty of Science, Radboud Institute for Molecular Life Sciences,Radboud University, Nijmegen, The Netherlands, ²Department of Dermatology, Radboud University Medical Center,Radboud Institute for Molecular Life Sciences, Nijmegen, The Netherlands, ³Department of Human Genetics,Radboud University Medical Center, Nijmegen, The Netherlands

Chapitres

00:04Introduction
01:10Human Primary Keratinocyte Differentiation by Contact Inhibition
02:20RNA-seq Data Analysis
04:53Results: Keratinocyte Differentiation and Analysis
06:47Conclusion

Summary

Traduction automatique

Présenté ici est une procédure stepwise pour la différenciation in vitro des kératinocytes primaires humains par inhibition de contact suivie de la caractérisation au niveau moléculaire par l’analyse d’ARN-seq.

Tags

In Vitro Keratinocyte Differentiation RNA-seq 2D Monolayer Proliferation Medium Differentiation Medium Cell Seeding Density RNA Isolation CDNA Conversion Library Preparation Next-generation Sequencing Read Mapping DESeq2 RLD Normalization VST Normalization

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