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Fenotipado de tensión de levadura de alto rendimiento con secuenciación de ARN basada en gotas
Journal JoVE
Bio-ingénierie
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Journal JoVE Bio-ingénierie
High Throughput Yeast Strain Phenotyping with Droplet-Based RNA Sequencing
DOI:

07:55 min

May 21, 2020

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Chapitres

  • 00:04Introduction
  • 00:29Yeast Encapsulation in Hydrogels Using Device A
  • 01:39Breaking and Washing Hydrogels
  • 02:58Yeast Colony Lysis
  • 04:04mRNA Capture Using Device B
  • 05:27Results: High-Throughput Screening of C. albicans
  • 07:24Conclusion

Summary

Traduction automatique

Un cuello de botella en el ciclo de ingeniería microbiana en el ciclo de "diseño-construcción-prueba" es la velocidad a la que podemos realizar pantallas funcionales de cepas. Describimos un método de alto rendimiento para el cribado de deformación unitaria aplicado a cientos a miles de células de levadura por experimento que utiliza la secuenciación de ARN basada en gotas.

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