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Optimization for Sequencing and Analysis of Degraded FFPE-RNA Samples
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Optimización para la secuenciación y el análisis de muestras de FFPE-ARN degradadas

DOI:
10.3791/61060-v

•

07:30 min

•

June 08, 2020

•

, , , , ,
1NCI CCR Sequencing Facility,Frederick National Laboratory for Cancer Research, 2Advanced Biomedical and Computational Sciences,Frederick National Laboratory for Cancer Research

Chapitres

  • 00:04Introduction
  • 01:21RNA Quantity and Quality Assessment
  • 02:03Sequencing
  • 04:01Data Analysis and Quality Assessment
  • 04:33Results: Representative Degraded Formalin-Fixed Paraffin Embedded (FFPE)- RNA Sample Sequencing and Analysis
  • 06:28Conclusion

Summary

Traduction automatique

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Este método describe los pasos para mejorar la calidad y la cantidad de datos de secuencia que se pueden obtener a partir de muestras de ARN incrustadas de parafina fija de formalina (FFPE). Describimos la metodología para evaluar con mayor precisión la calidad de las muestras de FFPE-RNA, preparar bibliotecas de secuenciación y analizar los datos de muestras de ARN FFPE.

Tags

FFPE-RNARNA QualityRNA DegradationSample QCLibrary PreparationSequencing ProcessRNA FragmentsSequencing ReagentsFlow CellSample LibraryPhiX Control

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