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크롬 마틴 면역 침전 -엑소뉴클레아제 (ChIP-Exo)를 사용하여 마우스 줄기 세포 유래 뉴런에서 단백질 DNA 상호 작용의 고해상도 매핑

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High-Resolution Mapping of Protein-DNA Interactions in Mouse Stem Cell-Derived Neurons using Chromatin Immunoprecipitation-Exonuclease (ChIP-Exo)

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크롬 마틴 면역 침전 -엑소뉴클레아제 (ChIP-Exo)를 사용하여 마우스 줄기 세포 유래 뉴런에서 단백질 DNA 상호 작용의 고해상도 매핑

DOI:

10.3791/61124-v

•

08:40 min

•

August 14, 2020

•

Kaitlin N. Montanera², Ho Sung Rhee²

¹Department of Cell and Systems Biology,University of Toronto, ²Department of Biology,University of Toronto

Chapitres

00:05Introduction
00:21Antibody Incubation with Beads
01:35Chromatin Immunoprecipitation (ChIP)
02:56Enzymatic Reactions on Beads
04:59Elution and Purification
05:43Library Preparation
06:50Results: ChIP-exo Produces High Mapping Resolution
08:04Conclusion

Summary

Traduction automatique

게놈 전반에 걸친 단백질 결합 위치의 정확한 결정은 유전자 조절을 이해하는 데 중요합니다. 여기서는 외핵증 소화(ChIP-exo)를 사용한 크로마틴-면역침전DNA를 치료하는 게놈 매핑 방법을 설명하고 있으며, 이어서 고처리량 시퀀싱을 한다. 이 방법은 포유류 뉴런에서 근거리 쌍 매핑 해상도 및 높은 신호 대 잡음 비와 단백질 DNA 상호 작용을 검출합니다.

Tags

ChIP-exo Protein-DNA Interactions Chromatin Immunoprecipitation High-resolution Mapping Mouse Stem Cell-derived Neurons Magnetic Beads Blocking Solution Islet-1 Antibody Sonicated Lysates Wash Buffer End Prep Reaction Mix End Prep Enzyme Mix

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