Journal
/
Génétique
/
Een Pathway Association Study Tool voor GWAS-analyses van metabole Pathway-informatie
Journal JoVE
Génétique
This content is Free Access.
Journal JoVE Génétique
A Pathway Association Study Tool for GWAS Analyses of Metabolic Pathway Information
Please note that all translations are automatically generated. Click here for the English version.

Een Pathway Association Study Tool voor GWAS-analyses van metabole Pathway-informatie

DOI:
10.3791/61268-v

•

05:01 min

•

July 01, 2020

•

,
1Institute for Genomics, Biocomputing & Biotechnology,Mississippi State University, 2Corn Host Plant Resistance Research Unit,USDA-ARS

Chapitres

  • 00:05Introduction
  • 00:32Genome-Wide Association Study (GWAS) Data Loading
  • 00:57Load Linkage Disequilibrium (LD) Data Loading
  • 01:26Single Nucleotide Polymorphism (SNP) Assignment
  • 01:56Significant Pathway Discovery
  • 02:35Rugplot Visualization
  • 03:21Results: Representative GWAS Analyses of Metabolic Pathway Information
  • 04:21Conclusion

Summary

Traduction automatique

Traduction automatique

Door de Pathway Association Study Tool (PAST) uit te voeren, hetzij via de Shiny-applicatie of via de R-console, kunnen onderzoekers een dieper inzicht krijgen in de biologische betekenis van hun genoombrede associatiestudie (GWAS) -resultaten door de betrokken metabole routes te onderzoeken.

Tags

GWASGenome-wide Association AnalysisMetabolic PathwayPASTPathway Association Study ToolSNPsLinkage DisequilibriumGene AnnotationPathway AnalysisRug PlotsR ConsoleShiny

Article

Embed

AJOUTER À LA PLAYLIST

Usage Statistics

Vidéos Connexes

check_url/fr/61268?article_type=v

Meting van differentieel gemethyleerde<em> INS</em> DNA-Species in monsters humaan serum als een Biomarker van Islet β Cell Death
check_url/fr/61268?article_type=v

Kwantificering van informatie gecodeerd door Gene Expression niveaus tijdens levensduur modulatie onder breed-scala dieet beperking in C. elegans
check_url/fr/61268?article_type=v

Metabole Labeling en profilering van overdracht RNAs met behulp van Macroarrays
check_url/fr/61268?article_type=v

Ultralow Input genoom Sequencing bibliotheek bereiding op basis van een enkel exemplaar van de Tardigrade
check_url/fr/61268?article_type=v

Methodologie voor nauwkeurige detectie van mitochondriaal DNA methylatie
check_url/fr/61268?article_type=v

High-throughput identificatie van regelgevende gensequenties met behulp van Next-generation Sequencing van circulaire chromosoom conformatie Capture (4C-seq)
check_url/fr/61268?article_type=v

Chromogene in situ hybridisatie SS een hulpmiddel voor HPV-gerelateerde hoofd-en nek kankerdiagnose
check_url/fr/61268?article_type=v

Navigeren MARRVEL, een web-based tool die Human Genomics en model organisme genetica informatie integreert
check_url/fr/61268?article_type=v

Massa spectrometrie gebaseerde Proteomics Analyses met behulp van de OpenProt Database te onthullen nieuwe eiwitten vertaald uit niet-canonieke Open lezing Frames
check_url/fr/61268?article_type=v

Een methode om de Novo vorming van Chromatin domeinen te bestuderen

Read Article