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Cristallografia a raggi X per studiare la transizione di stato oligomerica della termotoga maritima M42 Aminopeptidasi TmPep1050
Journal JoVE
Biochimie
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Journal JoVE Biochimie
X-Ray Crystallography to Study the Oligomeric State Transition of the Thermotoga maritima M42 Aminopeptidase TmPep1050
DOI:

11:27 min

May 13, 2020

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Chapitres

  • 00:04Introduction
  • 01:03Activity Assay
  • 02:19Apoenzyme Preparation
  • 03:32Dimer Preparation
  • 04:03Microseeding
  • 05:01X-Ray Diffraction
  • 05:48Indexation
  • 06:50Molecular Replacement
  • 08:04Model Building
  • 09:07Results: Representative Thermotoga Maritima M42 Aminopeptidase TmPep1050 Oligomeric State Transition
  • 10:50Conclusion

Summary

Traduction automatique

Questo protocollo è stato sviluppato per studiare la transizione dimero-dodecamero di TmPep1050, un'amminopeptidasi M42, a livello strutturale. È una pipeline semplice che parte dalla purificazione delle proteine all'elaborazione dei dati a raggi X. La cristallogenesi, l'indicizzazione del set di dati e la sostituzione molecolare sono state enfatizzate attraverso un caso di studio, variante TmPep1050H60A H307A.

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