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Recherche en cancérologie
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使用转录组学分析绘制无序致癌转录因子的结构-功能关系
Journal JoVE
Recherche en cancérologie
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Recherche en cancérologie
Mapping the Structure-Function Relationships of Disordered Oncogenic Transcription Factors Using Transcriptomic Analysis
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使用转录组学分析绘制无序致癌转录因子的结构-功能关系
DOI:
10.3791/61564-v
•
09:58 min
•
June 27, 2020
•
Iftekhar A. Showpnil
2
,
Kyle R. Miller
,
Cenny Taslim
,
Kathleen I. Pishas
,
Stephen L. Lessnick
3
,
Emily R. Theisen
4
1
Center for Childhood Cancer and Blood Diseases
,
Abigail Wexner Research Institute at Nationwide Children’s Hospital
,
2
Molecular, Cellular, and Developmental Biology Program
,
The Ohio State University
,
3
Division of Pediatric Hematology/Oncology/Blood & Marrow Transplant
,
The Ohio State University
,
4
Department of Pediatrics
,
The Ohio State University
Chapitres
00:04
Introduction
00:55
In Vitro Construct Panel Setup
02:07
Cell Collection
02:47
Construct Expression Validation and Correlative Phenotypic Assay Setup
03:50
Alignment and Transcript Counting Pipeline
05:32
Differential Expression
07:40
Results: Representative Disordered Oncogenic Transcription Factor Structure-Function Relationship Mapping
09:31
Conclusion
Summary
Traduction automatique
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Türkçe (Turkish)
Traduction automatique
内在无序结构域对致癌融合转录因子功能很重要。为了治疗靶向这些蛋白质,需要更详细地了解这些结构域所采用的调节机制。在这里,我们使用转录组学来绘制尤文氏肉瘤中内在无序的EWS结构域的重要结构特征。
Tags
Transcriptomics
Structure-function Analysis
Disordered Transcription Factors
Oncogenic Fusion Proteins
EWS/FLI
Partial Function Detection
RNA Sequencing
CDNA Expression
Virus Transduction
Cell Culture
Selection
Protein Extraction
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