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Cartographie des relations structure-fonction des facteurs de transcription oncogènes désordonnés à l’aide de l’analyse transcriptomique
Journal JoVE
Recherche en cancérologie
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Journal JoVE Recherche en cancérologie
Mapping the Structure-Function Relationships of Disordered Oncogenic Transcription Factors Using Transcriptomic Analysis
DOI:

09:58 min

June 27, 2020

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Chapitres

  • 00:04Introduction
  • 00:55In Vitro Construct Panel Setup
  • 02:07Cell Collection
  • 02:47Construct Expression Validation and Correlative Phenotypic Assay Setup
  • 03:50Alignment and Transcript Counting Pipeline
  • 05:32Differential Expression
  • 07:40Results: Representative Disordered Oncogenic Transcription Factor Structure-Function Relationship Mapping
  • 09:31Conclusion

Summary

Traduction automatique

Les domaines intrinsèquement désordonnés sont importants pour la fonction du facteur de transcription de fusion oncogène. Pour cibler thérapeutiquement ces protéines, une compréhension plus détaillée des mécanismes de régulation employés par ces domaines est nécessaire. Ici, nous utilisons la transcriptomique pour cartographier les caractéristiques structurelles importantes du domaine EWS intrinsèquement désordonné dans le sarcome d’Ewing.

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