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Una procedura ChIP-Seq semiautomatica per studi epigenetici su larga scala
Journal JoVE
Biologie
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Journal JoVE Biologie
A Semiautomated ChIP-Seq Procedure for Large-scale Epigenetic Studies
DOI:

08:04 min

August 13, 2020

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Chapitres

  • 00:05Introduction
  • 00:26Chromatin Shearing
  • 01:28Automated Chromatin Immunoprecipitation Sequencing (ChIP-Seq)
  • 03:03Library Adaptor Transposase Integration
  • 03:49Tagmented DNA Fragment Purification
  • 04:46Purified Sample Amplification and Size-Selection
  • 05:44Results: Representative Semiautomated ChIP-Seq
  • 07:27Conclusion

Summary

Traduction automatique

Questo articolo descrive un protocollo ChIP-Seq semiautomatico e microscalato di regioni del DNA associate a una specifica modificazione degli istoni (H3K27ac) utilizzando una piattaforma di gestione dei liquidi ChIP, seguita dalla preparazione della libreria utilizzando la tagmentazione. La procedura comprende la valutazione del controllo ai fini della qualità e della quantità e può essere adottata per altre modificazioni istoniche o fattori di trascrizione.

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