Journal
/
/
Uitgebreide workflow van op massaspectrometrie gebaseerde Shotgun Proteomics van weefselmonsters
Journal JoVE
Biologie
Author Produced
Un abonnement à JoVE est nécessaire pour voir ce contenu.  Connectez-vous ou commencez votre essai gratuit.
Journal JoVE Biologie
Comprehensive Workflow of Mass Spectrometry-based Shotgun Proteomics of Tissue Samples
DOI:

14:51 min

November 13, 2021

, , , ,

Chapitres

  • 00:00Introduction
  • 00:42Tissue Lysate Preparation
  • 01:51Quantification and Quality Check of Tissue Lysates
  • 02:33Enzymatic Digestion of Proteins
  • 03:57Desalting of Digested Peptides
  • 05:16Quantification of Desalted Peptides
  • 05:58Labeling of Digested Peptides using iTRAQ Reagents
  • 08:14Liquid Chromatography Set-up
  • 09:25Mass Spectrometry Set-up
  • 12:30Representative Results
  • 13:45Conclusions

Summary

Traduction automatique

Het beschreven protocol biedt een geoptimaliseerde kwantitatieve proteomics-analyse van weefselmonsters met behulp van twee benaderingen: labelgebaseerde en labelvrije kwantificering. Labelgebaseerde benaderingen hebben het voordeel van een nauwkeurigere kwantificering van eiwitten, terwijl een labelvrije aanpak kosteneffectiever is en wordt gebruikt om honderden monsters van een cohort te analyseren.

Vidéos Connexes

Read Article