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Flux de travail complet de protéomique des échantillons de tissus basée sur la spectrométrie de masse
Journal JoVE
Biologie
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Journal JoVE Biologie
Comprehensive Workflow of Mass Spectrometry-based Shotgun Proteomics of Tissue Samples
DOI:

14:51 min

November 13, 2021

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Chapitres

  • 00:00Introduction
  • 00:42Tissue Lysate Preparation
  • 01:51Quantification and Quality Check of Tissue Lysates
  • 02:33Enzymatic Digestion of Proteins
  • 03:57Desalting of Digested Peptides
  • 05:16Quantification of Desalted Peptides
  • 05:58Labeling of Digested Peptides using iTRAQ Reagents
  • 08:14Liquid Chromatography Set-up
  • 09:25Mass Spectrometry Set-up
  • 12:30Representative Results
  • 13:45Conclusions

Summary

Traduction automatique

Le protocole décrit fournit une analyse protéomique quantitative optimisée des échantillons de tissus à l’aide de deux approches : la quantification basée sur l’étiquette et la quantification sans étiquette. Les approches basées sur l’étiquette ont l’avantage d’une quantification plus précise des protéines, tandis qu’une approche sans étiquette est plus rentable et utilisée pour analyser des centaines d’échantillons d’une cohorte.

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