Journal
/
Biochimie
/
Semikvantitativ analyse af peptidoglycan ved væskekromatografi, massespektrometri og bioinformatik
Journal JoVE
Biochimie
Un abonnement à JoVE est nécessaire pour voir ce contenu.  Connectez-vous ou commencez votre essai gratuit.
Journal JoVE Biochimie
Semi-Quantitative Analysis of Peptidoglycan by Liquid Chromatography Mass Spectrometry and Bioinformatics

Semikvantitativ analyse af peptidoglycan ved væskekromatografi, massespektrometri og bioinformatik

DOI:
10.3791/61799-v

•

09:09 min

•

October 13, 2020

•

, , ,
1Department of Molecular and Cellular Biology,University of Guelph, 2Mass Spectrometry Facility,University of Guelph

Chapitres

  • 00:05Introduction
  • 01:07Peptidoglycan Sacculi Extraction
  • 03:17Liquid Chromatography-Mass Spectrometry (LC-MS) Chromatogram Spectral Processing
  • 04:11Differential Spectral Feature Analysis
  • 05:06Muropeptide Annotation Spectral Features
  • 06:18Muropeptide Global Change Modification Assessment
  • 07:07Results: Representative Muropeptide Fragmentation and Identification and Peptidoglycan Composition Analysis
  • 08:31Conclusion

Summary

Traduction automatique

Traduction automatique

Denne protokol dækker en detaljeret analyse af peptidoglycansammensætning ved hjælp af væskekromatografi, massespektrometri kombineret med avanceret funktionsekstraktion og bioinformatisk analysesoftware.

Tags

PeptidoglycanMass SpectrometryBioinformaticsPeptidoglycomicsSacculi ExtractionSDS TreatmentEnzymatic DigestionLiquid Chromatography-mass Spectrometry

Article

Embed

AJOUTER À LA PLAYLIST

Usage Statistics

Vidéos Connexes

Time-løst elektrosprayioniserings Brint-deuterium Exchange-massespektrometri til at studere proteiners struktur og Dynamics

Løsning affinitetsrensede proteinkomplekser ved Blå Native PAGE og protein Korrelation Profilering

En Tandem væskekromatografi-massespektrometri-baseret tilgang til Metabolit Analyse af<em> Staphylococcus aureus</em

Lipid Droplet Isolation for Kvantitativ massespektrometri Analyse

Dyb proteomet profilering af Isobar mærkning, omfattende væskekromatografi, massespektrometri og Software-assisteret kvantificering

Påvisning af proteinubiquitinationssteder ved peptidberigelse og massespektrometri

Nitropeptid profilering og identifikation illustreret af angiotensin II

Identifikation af inositol fosfat eller Phosphoinositide interagerende proteiner ved affinitets kromatografi koblet til Western blot eller massespektrometri

Absolut kvantificering af celle frit protein syntese metabolisme ved omvendt fase-væskekromatografi-massespektrometri

Kvantitativ analyse af cellulære lipidom af Saccharomyces Cerevisiae Ved hjælp af flydende kromatografi kombineret med tandem massespektrometri

Read Article