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液体クロマトグラフィー質量分析とバイオインフォマティクスによるペプチドグリカンの半定量分析

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Biochimie

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Semi-Quantitative Analysis of Peptidoglycan by Liquid Chromatography Mass Spectrometry and Bioinformatics

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液体クロマトグラフィー質量分析とバイオインフォマティクスによるペプチドグリカンの半定量分析

DOI:

10.3791/61799-v

•

09:09 min

•

October 13, 2020

•

Erin M. Anderson, Neil A. Greenwood, Dyanne Brewer, Cezar M. Khursigara

¹Department of Molecular and Cellular Biology,University of Guelph, ²Mass Spectrometry Facility,University of Guelph

Chapitres

00:05Introduction
01:07Peptidoglycan Sacculi Extraction
03:17Liquid Chromatography-Mass Spectrometry (LC-MS) Chromatogram Spectral Processing
04:11Differential Spectral Feature Analysis
05:06Muropeptide Annotation Spectral Features
06:18Muropeptide Global Change Modification Assessment
07:07Results: Representative Muropeptide Fragmentation and Identification and Peptidoglycan Composition Analysis
08:31Conclusion

Summary

Traduction automatique

このプロトコルは、液体クロマトグラフィー質量分析と高度な特徴抽出およびバイオインフォマティクス分析ソフトウェアを組み合わせたペプチドグリカン組成の詳細な分析をカバーしています。

Tags

Keywords: Peptidoglycan Mass Spectrometry Bioinformatics Peptidoglycomics Sacculi Extraction SDS Treatment Enzymatic Digestion Liquid Chromatography-mass Spectrometry

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