Здесь представлен протокол для подхода флуоресцентной визуализации, multiplex immunofluorescent cell-based detection DNA, RNA и protein (MICDDRP), метод, способный одновременно флуоресцентной одноклеточной визуализации вирусного белка и нуклеиновых кислот различного типа и цепкости. Этот подход может быть применен к широкому спектру систем.