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Journal JoVE Recherche en cancérologie
Characterization and Functional Prediction of Bacteria in Ovarian Tissues

Caracterização e Previsão Funcional de Bactérias em Tecidos Ovarianos

DOI:
10.3791/61878-v

•

10:12 min

•

October 23, 2021

•

, , , , , , , , , , , ,
1Department of Obstetrics and Gynecology,First Affiliated Hospital of Xi’an Jiaotong University, 2School of Social Sciences,University of Manchester, 3Department of Pathology,First Affiliated Hospital of Xi’an Jiaotong University, 4Omega Bioservices Inc

Chapitres

  • 00:03Introduction
  • 01:10Collect Samples
  • 01:47Perform Bacterial LPS’s: Immunohistochemistry in Ovaries
  • 03:50Detect 16S rRNA Sequencing
  • 05:0216S rRNA Sequencing Analysis
  • 06:09Predict Bacteria Function
  • 06:36Data
  • 07:09Representative Result
  • 09:47Conclusion

Summary

Traduction automatique

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A coloração imunohistoquímica e o sequenciamento do gene RNA ribossômico 16S (gene 16S rRNA) foram realizados a fim de descobrir e distinguir bactérias em tecidos ovarianos cancerígenos e não cancerígenos in situ. As diferenças composicionais e funcionais das bactérias foram previstas pelo uso do BugBase e da Investigação Filogenética das Comunidades por Reconstrução de Estados Não Observados (PICRUSt).

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Keywords: BacteriaImmunohistochemistry16S RRNA SequencingCharacterizationFunctional PredictionCancerNon-cancerBoPsCellular-genetic InvestigationIn SituParaffin EmbeddingAntigen RetrievalAntibody StainingDAP SubstrateHRP PolymerDehydration16S RRNA Sequencing Library Preparation

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