Journal
/
/
Divergens av rotmikrobiota i olika livsmiljöer baserat på viktade korrelationsnätverk
Journal JoVE
Biologie
Author Produced
Un abonnement à JoVE est nécessaire pour voir ce contenu.  Connectez-vous ou commencez votre essai gratuit.
Journal JoVE Biologie
Divergence of Root Microbiota in Different Habitats based on Weighted Correlation Networks
DOI:

09:49 min

September 25, 2021

, , , ,

Chapitres

  • 00:06Introduction
  • 00:46I. Data Download
  • 01:05II. Optimal Power Value Determination
  • 02:38III. Construction of a Co-Expression Network and Module Identification
  • 04:25IV. Preservation Test
  • 05:44V. Correlation Analysis of the Module Membership
  • 06:55VI. Analysis of the Microbial Flora in the Microbial Differential Network Module
  • 07:43Resuts: Analysis of Differences in Rice delavayi Root Microbial Communities Based on Weighted Co‐Expression Network
  • 09:18Conclusion

Summary

Traduction automatique

Nätverksanalys tillämpades för att utvärdera associeringen av olika ekologiska mikrobiella samhällen, såsom jord, vatten och rhizosfär. Här presenteras ett protokoll om hur du använder WGCNA-algoritmen för att analysera olika samförekomstnätverk som kan uppstå i mikrobiella samhällen på grund av olika ekologiska miljöer.

Vidéos Connexes

Read Article