Nätverksanalys tillämpades för att utvärdera associeringen av olika ekologiska mikrobiella samhällen, såsom jord, vatten och rhizosfär. Här presenteras ett protokoll om hur du använder WGCNA-algoritmen för att analysera olika samförekomstnätverk som kan uppstå i mikrobiella samhällen på grund av olika ekologiska miljöer.