/

/

深層学習を用いてメタジノミックデータの生物学的配列を分類するための非コンピュータ専門家のための仮想マシンプラットフォーム

Journal JoVE
Génétique
Author Produced

Un abonnement à JoVE est nécessaire pour voir ce contenu. Connectez-vous ou commencez votre essai gratuit.

Journal JoVE Génétique

A Virtual Machine Platform for Non-Computer Professionals for Using Deep Learning to Classify Biological Sequences of Metagenomic Data

Please note that all translations are automatically generated. Click here for the English version.

深層学習を用いてメタジノミックデータの生物学的配列を分類するための非コンピュータ専門家のための仮想マシンプラットフォーム

DOI:

10.3791/62250-v

•

09:34 min

•

September 25, 2021

•

Zhencheng Fang², Hongwei Zhou³

¹Microbiome Medicine Center, Department of Laboratory Medicine, Zhujiang Hospital,Southern Medical University, ²Center for Quantitative Biology,Peking University, ³State Key Laboratory of Organ Failure Research,Southern Medical University

Chapitres

00:07Introduction
01:35The Installation of the Virtual Machine
04:11Create Shared Folders and Prepare the Files for the Training Set and Test Set
06:55Digitize the Biological Sequences Using “One‐Shot” Encoding Form
07:27Train and Test the Artificial Neural Network
08:12Result
08:52Conclusion

Summary

Traduction automatique

このチュートリアルでは、メタゲノムデータの 2 クラスシーケンス分類を実行するためのディープラーニングアルゴリズムを構築する簡単な方法について説明します。

Tags

Virtual Machine Deep Learning Biological Sequence Classification Metagenomic Data Species Classification Gene Function Classification Host Classification Deep Learning Framework Sequence Classification VirtualBox Ubuntu

Article

Embed

AJOUTER À LA PLAYLIST

Usage Statistics

Vidéos Connexes

ハイスループットプロトプラスト単離と変革のためのロボットプラットフォーム

過敏性腸症候群におけるmiRNA循環の摂動は多重化ハイスループット遺伝子発現プラットフォームを使用して検出します

サイレージのメタゲノム解析

GFPタグTMEM184Aを使用すると、ヘパリン受容体のアイデンティティの確認のために構築します

Cpf1を用いたC-ブリックDNA標準アセンブリのプロトコール

堅牢な DNA の隔離および標本の高スループットシーケンスライブラリーの構築

CRISPR/Cas9 仲介の対象となる統合生体内で相同性を介した終わり参加ベースの戦略を使用して

バッチ酵母 2 ハイブリッドスクリーンからシーケンスデータの情報解析

円の染色体構造の次世代シーケンシングによる遺伝子制御配列の高スループット識別キャプチャ (4 C seq)

分裂酵母分裂酵母のディープシーケンスアシスト、自発的な抑制画面

Read Article