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A Mass Spectrometry-Based Proteomics Approach for Global and High-Confidence Protein R-Methylation Analysis
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Un enfoque proteómico basado en espectrometría de masas para el análisis global y de alta confianza de la proteína R-metilación

DOI:
10.3791/62409-v

•

09:40 min

•

April 28, 2022

•

, , ,
1Department of Experimental Oncology,European Institute of Oncology IRCCS (IEO), 2European School of Molecular Medicine (SEMM), c/o Campus IFOM-IEO

Chapitres

  • 00:04Introduction
  • 00:44Lysate Digestion
  • 02:08Off‐Line HpH‐RP Chromatographic Fractionation of Peptides
  • 02:53R‐Methylated Peptide Immuno‐Affinity Enrichment
  • 06:47Results: R‐Methylation Analysis by Mass Spectrometry
  • 08:39Conclusion

Summary

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La proteína arginina (R)-metilación es una modificación postraduccional muy extendida que regula múltiples vías biológicas. La espectrometría de masas es la mejor tecnología para perfilar globalmente el R-metil-proteoma, cuando se combina con enfoques bioquímicos para el enriquecimiento peptídico modificado. El flujo de trabajo diseñado para la identificación de alta confianza de la R-metilación global en células humanas se describe aquí.

Tags

Mass SpectrometryProteomicsProtein R-methylationPRMT InhibitorsDTTIodoacetamideTrypsinLysargiNaseHigh PH Reversed Phase Liquid ChromatographyImmuno-affinity Enrichment

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