Journal
/
/
RIBO-seq i bakterier: ett protokoll för insamling av prover och biblioteksförberedelser för NGS-sekvensering
Journal JoVE
Biochimie
Author Produced
Un abonnement à JoVE est nécessaire pour voir ce contenu.  Connectez-vous ou commencez votre essai gratuit.
Journal JoVE Biochimie
RIBO-seq in Bacteria: a Sample Collection and Library Preparation Protocol for NGS Sequencing
DOI:

12:05 min

August 07, 2021

, , , ,

Chapitres

  • 00:00Introduciton
  • 00:54Cell Harvesting and Lysis
  • 04:13MNase Digestion and Size Selection of Samples for RIBO-seq
  • 06:17rRNA Depletion and Alkaline Fragmentation of Samples for RNA-seq
  • 07:07Library Preparation and Size Selection of cDNA Libraries
  • 08:49Results: Quality of cDNA Libraries and Reads
  • 11:31Conclusion

Summary

Traduction automatique

Här beskriver vi stadierna av provtagning och förberedelse för RIBO-seq i bakterier. Sekvensering av de bibliotek som utarbetats enligt dessa riktlinjer resulterar i tillräckliga data för omfattande bioinformatisk analys. Protokollet vi presenterar är enkelt, använder standard laboratorieutrustning och tar sju dagar från lysis till att få bibliotek.

Vidéos Connexes

Read Article