Using Next Generation Sequencing to Identify Mutations Associated with Repair of a CAS9-induced Double Strand Break Near the CD4 Promoter

Changkun Hu; Tyler Doerksen; Taylor Bugbee; Nicholas A. Wallace; Rachel Palinski

doi:10.3791/62583

/

Utilisation du séquençage de nouvelle génération pour identifier les mutations associées à la réparation d’une rupture double brin induite par CAS9 près du promoteur CD4

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Génétique

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Using Next Generation Sequencing to Identify Mutations Associated with Repair of a CAS9-induced Double Strand Break Near the CD4 Promoter

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Utilisation du séquençage de nouvelle génération pour identifier les mutations associées à la réparation d’une rupture double brin induite par CAS9 près du promoteur CD4

DOI:

10.3791/62583-v

•

06:59 min

•

March 31, 2022

•

Changkun Hu*¹, Tyler Doerksen*², Taylor Bugbee, Nicholas A. Wallace, Rachel Palinski³

¹Division of Biology,Kansas State University, ²Kansas State Veterinary Diagnostic Laboratory,Kansas State University, ³Department of Diagnostic Medicine/Pathobiology,Kansas State University

Chapitres

00:05Introduction
00:41Cell Plating
02:21Transfection
04:42Results: Identifying the Mutations Associated with Double Strand Break Repair near the CD4 Promoter
06:15Conclusion

Summary

Traduction automatique

Présenté ici est sgRNA/CAS9 endonucléase et protocole de séquençage de nouvelle génération qui peut être utilisé pour identifier les mutations associées à la réparation de rupture double brin près du promoteur CD4.

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Analyse du promoteur du ligand c-KIT utilisant l'immunoprécipitation de la chromatine

Génération d’immunoprécipitation de la chromatine Native séquençage des bibliothèques pour l’analyse de densité de nucléosomes

Génération d’un gène-perturbé Streptococcus mutans souche sans gène clonage

Ciblé le séquençage Next-generation et bioinformatique Pipeline afin d’évaluer les déterminants génétiques de la maladie constitutionnelle

Capture promoteur Salut-c : Haute résolution, Genome-wide profilage des Interactions de promoteur

Amplification de près de provirus pleine longueur de VIH-1 pour l’ordonnancement de prochaine génération

High-throughput Identification des séquences régulatrices du gène à l’aide de prochaine génération séquençage du Chromosome circulaire Conformation Capture (4C-seq)

Utilisation du séquençage de nouvelle génération pour identifier les mutations associées à la réparation d’une rupture double brin induite par CAS9 près du promoteur CD4

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