Journal
/
Biochimie
/
Large-scale Multi-omics Genome-wide Association Studies (Mo-GWAS): Retningslinjer for prøveforberedelse og normalisering
Journal JoVE
Biochimie
This content is Free Access.
Journal JoVE Biochimie
Large-Scale Multi-Omics Genome-Wide Association Studies (Mo-GWAS): Guidelines for Sample Preparation and Normalization

Large-scale Multi-omics Genome-wide Association Studies (Mo-GWAS): Retningslinjer for prøveforberedelse og normalisering

DOI:
10.3791/62732-v

•

08:27 min

•

July 27, 2021

•

, ,
1Max-Planck-Institute of Molecular Plant Physiology, 2Center of Plant Systems Biology and Biotechnology

Chapitres

  • 00:04Introduction
  • 00:48Preparation of Biological Plant Material
  • 01:57Sample Extraction
  • 03:35UHPLC-MS Analysis of Semi-Polar Metabolites and Normalization of Large-Scale Metabolomics Dataset
  • 05:37Genome-Wide Association Studies (GWAS)
  • 06:26Results: Metabolomics Data Normalization and QTL Visualization
  • 07:45Conclusion

Summary

Traduction automatique

Traduction automatique

I denne protokol præsenterer vi en optimeret arbejdsgang, som kombinerer en effektiv og hurtig prøveforberedelse af mange prøver. Derudover giver vi en trinvis vejledning til at reducere analytiske variationer til evaluering af metaboliske GWAS-undersøgelser med høj kapacitet.

Tags

Keywords: Multi-omicsGenome-wide Association StudiesMo-GWASSample PreparationNormalizationTechnical VariationBiological VarianceMetabolitesAnalytical PlatformGenotypic InformationPhenotypic InformationNatural PopulationFlash FreezingExtractionCentrifugationSolvent EvaporationGCMSUHPLC-MS

Article

Embed

AJOUTER À LA PLAYLIST

Usage Statistics

Vidéos Connexes

check_url/fr/62732?article_type=v

Prøveforberedelse til massespektrometri-baseret identifikation af RNA-bindende regioner
check_url/fr/62732?article_type=v

Genome-wide kvantificering af oversættelse i spirende gær af ribosomet profilering
check_url/fr/62732?article_type=v

Plade-baserede storstilet dyrkning af Caenorhabditis elegans: forberedelse af prøver til undersøgelse af stofskifteforandringer i Diabetes
check_url/fr/62732?article_type=v

En all-in-One-prøve holder til makromolekylær røntgenkrystallografi med minimal baggrunds spredning
check_url/fr/62732?article_type=v

Prøve forberedelse til Sonde Elektrospray Ionization Mass Spektrometri
check_url/fr/62732?article_type=v

Label-fri Immunoprecipitation massespektrometri workflow for storstilet nuklear Interactome profilering
check_url/fr/62732?article_type=v

TMT Prøve forberedelse til Proteomics Facility Indsendelse og efterfølgende dataanalyse
check_url/fr/62732?article_type=v

En prøveforberedelsespipeline til mikrokrystaller på VMXm Beamline
check_url/fr/62732?article_type=v

Forberedelse af højtemperaturprøvegitre til Cryo-EM
check_url/fr/62732?article_type=v

Prøvepræparat og relativ kvantitet ved hjælp af reduktiv methylering af aminer til peptidomicsstudier

Read Article