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Études d’association multi-omiques à grande échelle à l’échelle du génome (Mo-GWAS): Lignes directrices pour la préparation et la normalisation des échantillons
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Large-Scale Multi-Omics Genome-Wide Association Studies (Mo-GWAS): Guidelines for Sample Preparation and Normalization
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Études d’association multi-omiques à grande échelle à l’échelle du génome (Mo-GWAS): Lignes directrices pour la préparation et la normalisation des échantillons

DOI:
10.3791/62732-v

•

08:27 min

•

July 27, 2021

•

, ,
1Max-Planck-Institute of Molecular Plant Physiology, 2Center of Plant Systems Biology and Biotechnology

Chapitres

  • 00:04Introduction
  • 00:48Preparation of Biological Plant Material
  • 01:57Sample Extraction
  • 03:35UHPLC-MS Analysis of Semi-Polar Metabolites and Normalization of Large-Scale Metabolomics Dataset
  • 05:37Genome-Wide Association Studies (GWAS)
  • 06:26Results: Metabolomics Data Normalization and QTL Visualization
  • 07:45Conclusion

Summary

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Dans ce protocole, nous présentons un flux de travail optimisé, qui combine une préparation efficace et rapide des échantillons de nombreux échantillons. En outre, nous fournissons un guide étape par étape pour réduire les variations analytiques pour l’évaluation à haut débit des études GWAS métaboliques.

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Keywords: Multi-omicsGenome-wide Association StudiesMo-GWASSample PreparationNormalizationTechnical VariationBiological VarianceMetabolitesAnalytical PlatformGenotypic InformationPhenotypic InformationNatural PopulationFlash FreezingExtractionCentrifugationSolvent EvaporationGCMSUHPLC-MS

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