Un abonnement à JoVE est nécessaire pour voir ce contenu. Connectez-vous ou commencez votre essai gratuit.
Chapitres
- 00:04Introduction
- 01:03Setup of JUMPn Software
- 01:31Demo Run Using an Example Dataset
- 06:04Results: Workflow of JUMPn Software and the Protein-Protein Interaction Database
- 07:00Conclusion
Мы представляем инструмент системной биологии JUMPn для выполнения и визуализации сетевого анализа количественных данных протеомики с подробным протоколом, включающим предварительную обработку данных, кластеризацию коэкспрессии, обогащение путей и сетевой анализ белково-белкового взаимодействия.
Tags
Keywords:
Protein Co-expressionClusteringNetwork AnalysisProteomicsJUMPn SoftwareCo-expression ClusteringPathway EnrichmentPPI Module DetectionUser-friendly InterfaceInteractive VisualizationPhosphoproteomicsInteractome DataWGCNA AlgorithmCo-expression PatternsTrends PlotPathway Ontology Enrichment Heatmap
