This content is Free Access.
Chapitres
- 00:04Introduction
- 01:00dsDNA Pool Cleanup and Concentration
- 03:25Sequence the Genome Library
- 05:14Long (MinION) Reads
- 06:55Generating Hybrid Genome Assembly
- 08:34Assessing Assembly Quality
- 09:34Genome Annotation
- 10:07Results: Analysis of Extracted DNA and Complete Genome Sequencing of Urinary Bacteria
- 11:37Conclusion
Denne protokol beskriver en omfattende tilgang til dyrkning, sekventering, og de novo hybrid genom samling af urinbakterier. Det giver en reproducerbar procedure for generering af komplette, cirkulære genomsekvenser, der er nyttige til at studere både kromosomale og ekstrakromosomgene genetiske elementer, der bidrager til urinkolonisering, patogenese og antimikrobiel resistensformidling.
