Her presenterer vi en optimalisert protokoll for avbildning av hele eggstokkene for kvantitative og kvalitative analyser ved hjelp av helmontert immunstaining, multifotonmikroskopi og 3D-visualisering og analyse. Denne protokollen har plass til høy gjennomstrømning, pålitelig og repeterbar behandling som gjelder for toksikologi, klinisk diagnostikk og genomiske analyser av eggstokkfunksjonen.