Journal
/
Biologie
/
Iboende Dynamics Visualizer, et interaktivt program for evaluering og visualisering av utdata fra en datasamlebånd for genregulatoriske nettverk
Journal JoVE
Biologie
Un abonnement à JoVE est nécessaire pour voir ce contenu.  Connectez-vous ou commencez votre essai gratuit.
Journal JoVE Biologie
Inherent Dynamics Visualizer, an Interactive Application for Evaluating and Visualizing Outputs from a Gene Regulatory Network Inference Pipeline

Iboende Dynamics Visualizer, et interaktivt program for evaluering og visualisering av utdata fra en datasamlebånd for genregulatoriske nettverk

DOI:
10.3791/63084-v

•

10:44 min

•

December 07, 2021

•

, , , ,
1Department of Biology,Duke University, 2Department of Mathematical Sciences,Montana State University, 3Department of Mathematical Sciences,Florida Atlantic University

Chapitres

  • 00:04Introduction
  • 00:46Node Finding
  • 03:40Edge Finding
  • 05:32Network Finding
  • 08:14Results: Investigating the Core Oscillator Gene Regulatory Network of the Yeast Cell-Cycle
  • 10:06Conclusion

Summary

Traduction automatique

Traduction automatique

Inherent Dynamics Visualizer er en interaktiv visualiseringspakke som kobles til et genregulatoriske nettverksinnledningsverktøy for forbedret, strømlinjeformet generering av funksjonelle nettverksmodeller. Visualisatoren kan brukes til å ta mer informerte beslutninger for å parameterisere inferensverktøyet, og dermed øke tilliten til de resulterende modellene.

Tags

Gene Regulatory NetworkInference PipelineInherent Dynamics VisualizerInteractive ApplicationVisualizationParameter ExplorationTime Series DataAnnotation FileOutput FileNumber Of ProcessesDLxJTKCutoffGene List

Article

Embed

AJOUTER À LA PLAYLIST

Usage Statistics

Vidéos Connexes

check_url/fr/63084?article_type=v

Regulatory T cells: Therapeutic Potential for Treating Transplant Rejection and Type I Diabetes
check_url/fr/63084?article_type=v

Using an Automated Cell Counter to Simplify Gene Expression Studies: siRNA Knockdown of IL-4 Dependent Gene Expression in Namalwa Cells
check_url/fr/63084?article_type=v

Kvantitative Sammenligning av Cis-Regulatory Element (CRE) Aktiviteter i Transgen Drosophila melanogaster</em
check_url/fr/63084?article_type=v

Bruke SecM Arrest sekvens som et verktøy for å isolere ribosom Innbundne polypeptider
check_url/fr/63084?article_type=v

Selektiv Capture av 5-hydroxymethylcytosine fra genomisk DNA
check_url/fr/63084?article_type=v

En rask og pålitelig Pipeline for Bakteriell transkriptomet Analyse Case: Serine avhengig Gene forordning<em> Streptococcus pneumoniae</em
check_url/fr/63084?article_type=v

Visualisering Stromule Frequency med Fluorescensmikroskopi
check_url/fr/63084?article_type=v

En enkel metode for isolering av soyabønner Protoplasts og programmet forbigående Gene Expression analyser
check_url/fr/63084?article_type=v

Fotodiodebasert optisk bildebehandling for opptak av nettverksdynamikk med enkel nevronoppløsning i ikke-transgene hvirvelløse dyr
check_url/fr/63084?article_type=v

En bioinformatikkrørledning for undersøkelse av molekylær evolusjon og genuttrykk ved hjelp av RNA-seq

Read Article