Journal
/
Biochimie
/
Hagelgevär Proteomics provbehandling automatiserad av en labbrobot med öppen källkod
Journal JoVE
Biochimie
Un abonnement à JoVE est nécessaire pour voir ce contenu.  Connectez-vous ou commencez votre essai gratuit.
Journal JoVE Biochimie
Shotgun Proteomics Sample Processing Automated by an Open-Source Lab Robot
Please note that all translations are automatically generated. Click here for the English version.

Hagelgevär Proteomics provbehandling automatiserad av en labbrobot med öppen källkod

DOI:
10.3791/63092-v

•

10:12 min

•

October 28, 2021

•

, , , ,
1Department of Medicine-Cardiology,University of Colorado Anschutz Medical Campus, 2Department of Biochemistry & Molecular Genetics,University of Colorado Anschutz Medical Campus, 3Consortium for Fibrosis Research & Translation, School of Medicine,University of Colorado Anschutz Medical Campus

Chapitres

  • 00:04Introduction
  • 00:40Mass Spectrometry (MS) Sample Preparation with a Single Protein
  • 04:44Peptide Clean-up Using SP3 Paramagnetic Beads
  • 06:19MS Sample Preparation with Protein Lysate
  • 08:37Results: Mass Spectrometry Proteomics with a Single Protein Standard Bovine Serum Albumin and a Detergent-Containing Human Heart Lysate Sample
  • 09:44Conclusion

Summary

Traduction automatique

Traduction automatique

Detaljerade protokoll och tre Python-skript tillhandahålls för att driva ett robotiserat vätskehanteringssystem med öppen källkod för att utföra halvautomatiska proteinprovberedningar för massspektrometriexperiment, som täcker tvättmedelsborttagning, proteinrötning och peptidavsaltning.

Tags

Shotgun ProteomicsAutomated Sample ProcessingOpen-source Lab RobotLiquid Handling SystemMass SpectrometryProtein BiochemistryProteomic StudiesAmmonium BicarbonateDTTTemperature ControlAutomationOpen-source Python Scripts

Article

Embed

AJOUTER À LA PLAYLIST

Usage Statistics

Vidéos Connexes

Automatiserad Acoustic Utlämning för serieutspädning av peptidagonister i Styrka Fastställande Analyser

LERLIC-MS / MS för Djupgående Karakterisering och kvantifiering av glutamin och asparagin Deamidering i Shotgun proteomik

Kalibrering-gratis In Vitro kvantifiering av Protein Homo-oligomerisering använder kommersiella instrumentering och fri, öppen källkod ljusstyrka analys programvara

Beredning av kloroplast sub fack från Arabidopsis för analys av Protein lokalisering av Immunoblotting eller proteomik

Detektion av protein ubiquitination platser av peptidanrikning och masspektrometri

Med öppen källkod MALDI TOF-MS IDBac pipeline för analys av mikrobiellt protein och specialiserade Metabolitdata

En allt-i-ett-provhållare för makro molekyl ära röntgenkristallografi med minimal bakgrunds spridning

Ett plasmaprovförberedelse för masspektrometri med hjälp av en automatiserad arbetsstation

TMT Provberedning för Proteomics Facility Submission och efterföljande dataanalys

Göra exakta och exakta enmolekyliga FRET-mätningar med hjälp av SmfBox med öppen källkod

Read Article