/

/

使用分子可视化免费软件对酶活性位点进行建模

Journal JoVE
Biochimie
Author Produced

This content is Free Access.

Journal JoVE Biochimie

Modeling an Enzyme Active Site using Molecular Visualization Freeware

Please note that all translations are automatically generated. Click here for the English version.

使用分子可视化免费软件对酶活性位点进行建模

DOI:

10.3791/63170-v

•

14:37 min

•

December 25, 2021

•

Kristen Procko, Sandy Bakheet, Josh T. Beckham, Margaret A. Franzen, Henry Jakubowski, Walter R. P. Novak

¹The University of Texas at Austin, ²Mount Mary University, ³College of St. Benedict/St. John’s University, ⁴Wabash College

Chapitres

00:05Introduction
01:42Protocol: UCSF ChimeraX
03:14Results: UCSF ChimeraX
03:33iCN3D Protocol
06:38Results: iCN3D
07:02Protocol: Jmol
09:47Results: Jmol
10:08Protocol: PyMOL
12:56Results: PyMOL
14:01Conclusion

Summary

Traduction automatique

生物分子建模的一项关键技能是显示和注释蛋白质中的活性位点。该技术使用四种流行的大分子可视化免费程序进行演示：iCn3D，Jmol，PyMOL和UCSF ChimeraX。

Tags

Keywords: Molecular Visualization Enzyme Active Site Glucokinase PDBID 3FGU Ligands Substrate Analog Catalytic Complex Binding Interactions UCSF ChimeraX Molecular Modeling Biological Macromolecules Visualization Software

Article

Embed

AJOUTER À LA PLAYLIST

Usage Statistics

Vidéos Connexes

映射的适体对ATP的结合部位使用MicroScale程序热泳

寡肽竞争测定磷酸化位点测定

体外和体内实验的位定向诱变-以大肠杆菌rna相互作用为例

通过后染色方法在聚丙烯酰胺凝胶中对芒果标记RNA的荧光可视化

富玛莱酸氢酶含含蛋白质的表达、纯化、结晶和酶测定

使用膜内消化技术评估蛋白质与蛋白质相互作用

使用新激酶蛋白的强生化方法在分子水平上进行表征

使用免疫荧光对患有TNBS诱导克罗恩病的小鼠结肠雌激素受体的可视化

单分子鱼的转录活性等位基因单细胞分析

网站特定赖氨酸乙酰化的组蛋白为核体重组使用遗传密码扩展在埃斯切里西亚大肠杆菌

Read Article