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Microdisseção laser industrializada e guiada por inteligência artificial para análise proteômica microescalada do Microambiente tumoral
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Journal JoVE Recherche en cancérologie
Industrialized, Artificial Intelligence-guided Laser Microdissection for Microscaled Proteomic Analysis of the Tumor Microenvironment

Microdisseção laser industrializada e guiada por inteligência artificial para análise proteômica microescalada do Microambiente tumoral

DOI:
10.3791/64171-v

•

13:01 min

•

June 03, 2022

•

, , , , , , , ,
1Women’s Health Integrated Research Center, Gynecologic Cancer Center of Excellence, Department of Obstetrics and Gynecology,Uniformed Services University and Walter Reed National Military Medical Center, 2The Henry M. Jackson Foundation for the Advancement of Military Medicine, 3The John P. Murtha Cancer Center Research Program, Department of Surgery,Uniformed Services University, 4Women’s Health Integrated Research Center, Inova Women’s Service Line,Inova Health System

Chapitres

  • 00:04Introduction
  • 01:07LMD Slide(s) Preparation
  • 01:58Automated Feature Selection Using Image Analysis Software
  • 06:58Laser Microdissectionvvv
  • 09:41Protein Digestion by Pressure-Cycle Technology (PCT) and Sample Analysis Using Liquid Chromatography-Tandem Mass Spectrometry (LC-MS/MS)
  • 10:55Results: Analysis of the Proteins in LMD-Enriched and Whole Tumor Samples
  • 12:09Conclusion

Summary

Traduction automatique

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Este protocolo descreve um fluxo de trabalho de alto rendimento para segmentação de regiões de interesse confirmadas pela patologia de imagens de seção de tecidos manchados e finos para enriquecimento de populações celulares resolvidas por histologia usando microdisseção a laser. Esta estratégia inclui um novo algoritmo que permite a transferência de demarcações denotando populações celulares de interesse diretamente para microscópios a laser.

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Keywords: AI-driven Image AnalysisLaser MicrodissectionProteomic AnalysisTumor MicroenvironmentPathomicsCalibration FiducialsPEN MembraneImage Analysis SoftwareAnnotationsPartitioningTiled AnnotationsPython Dapa Algorithm

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