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Isolamento de núcleos de tecido hepático congelado por flash para multiômica unicelular
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Journal JoVE Biologie
Isolation of Nuclei from Flash-Frozen Liver Tissue for Single-Cell Multiomics

Isolamento de núcleos de tecido hepático congelado por flash para multiômica unicelular

DOI:
10.3791/64792-v

•

09:09 min

•

December 09, 2022

•

, , ,
1Helmholtz Pioneer Campus (HPC),Helmholtz Munich, 2Institute of Computational Biology, Computational Health Department,Helmholtz Munich, 3Division of Infectious Diseases and Tropical Medicine,Ludwig-Maximillian-Universität Klinikum, 4TUM School of Medicine,Technical University of Munich

Chapitres

  • 00:04Introduction
  • 00:57Nuclei Isolation
  • 05:11Nuclei Sorting for Hepatocyte Ploidy Profiling or Well-Based Sequencing Approaches
  • 06:36Results: Isolation of Nuclei from Flash-Frozen, Archived Liver Tissues for Single-Nucleus RNA-Seq, ATAC-Seq, and Joint Multiomics
  • 08:39Conclusion

Summary

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Aqui, apresentamos um protocolo para isolar núcleos de tecidos hepáticos arquivados congelados por flash para RNA-seq, ATAC-seq de núcleo único e multiômica articular (RNA-seq e ATAC-seq).

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Nuclei IsolationSingle-cell MultiomicsDensity Gradient CentrifugationIodixanolCell StrainerBio-archived Human Liver SamplesMouse ModelNon-human Primate

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