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Den Einfluss von Bakteriophagen in gemäßigten Breiten auf ihre Lysogene durch Transkriptomik verstehen
Journal JoVE
Biologie
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Journal JoVE Biologie
Understanding the Impact of Temperate Bacteriophages on Their Lysogens Through Transcriptomics
DOI:

09:23 min

January 05, 2024

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Chapitres

  • 00:04Introduction
  • 01:20Temporal Direct Enumeration of Spontaneous Induction
  • 02:56Preparation of Un‐Induced and Induced Lysogen Cultures for RNA Extraction
  • 05:00Standard Curve and Quantitative‐PCR
  • 06:42Results: Understanding the Impact of Prophages on Their Hosts Using PFU and RT‐qPCR
  • 08:23Conclusion

Summary

Traduction automatique

Dieses Protokoll ermöglicht es, die Auswirkungen von Prophagen auf ihre Wirte aufzudecken. Die Bakterienkulturen werden unter Bedingungen synchronisiert, die den lysogenen Zustand am besten unterstützen und die spontane Induktion begrenzen. Die RT-qPCR unterscheidet eindeutig zwischen Prophagen-restriktiven Genen und solchen, die von der Phagenkontrolle abgekoppelt sind, von solchen, die während des lytischen Replikationszyklus exprimiert werden.

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