Ultra-Fast Amplicon-Based Next-Generation Sequencing in Non-Squamous Non-Small Cell Lung Cancer

Christophe Bontoux; Virginie Lespinet-Fabre; Olivier Bordone; Virginie Tanga; Maryline Allegra; Myriam Salah; Salom&#233; Lalv&#233;e; Samantha Goffinet; Jonathan Benzaquen; Charles-Hugo Marquette; Marius Ili&#233;; V&#233;ronique Hofman; Paul Hofman

doi:10.3791/65190

Assessing Genomic Alteration in Non-Squamous Non-Small Cell Lung Cancer Patients

September 08, 2023

Ultrasnelle amplicon-gebaseerde sequencing van de volgende generatie bij niet-plaveiselcelkanker

02:14 min

•

Voorbereiding van FFPE DNA- en RNA-monsters voor sequencing met behulp van een geautomatiseerd zuiveringsinstrument (API)

02:34 min

•

Op amplicon gebaseerde sequencing van de volgende generatie van niet-plaveiselcelkanker

01:13 min

•

Sequentieanalyse van niet-plaveiselcelkanker van niet-kleincellige longkanker met behulp van geïntegreerde genomische viewersoftware

02:11 min

•

Christophe Bontoux^2,3,4,5, Virginie Lespinet-Fabre^2,3,4, Olivier Bordone^2,3,4, Virginie Tanga^2,3,4, Maryline Allegra^2,3,4, Myriam Salah^2,3,4, Salomé Lalvée^2,3,4, Samantha Goffinet^2,3,4, Jonathan Benzaquen^4,5,6, Charles-Hugo Marquette^4,5,6, Marius Ilié^2,3,4,5, Véronique Hofman^2,3,4,5, Paul Hofman^2,3,4,5

¹Laboratory of Clinical and Experimental Pathology, Centre Hospitalier Universitaire de Nice,Université Côte d’Azur, CHU de Nice, ²Hospital-Integrated Biobank (BB-0033-00025),Université Côte d’Azur, Hôpital Pasteur, CHU de Nice, ³Institut Hospitalo-Universitaire (IHU), RespirERA,Université Côte d’Azur, Hôpital Pasteur, CHU de Nice, ⁴FHU OncoAge,Université Côte d’Azur, ⁵Team 4, Institute of Research on Cancer and Aging (IRCAN), CNRS INSERM, Centre Antoine-Lacassagne,Université Côte d’Azur, ⁶Department of Pulmonary Medicine and Thoracic Oncology, Centre Hospitalier Universitaire de Nice,Université Côte d’Azur

Summary

De toename van moleculaire biomarkers die moeten worden getest voor niet-plaveiselcelcarcinoom niet-kleincellige longkanker (NS-NSCLC) zorgmanagement heeft geleid tot de ontwikkeling van snelle en betrouwbare moleculaire detectiemethoden. We beschrijven een workflow voor de beoordeling van genomische veranderingen voor NS-NSCLC-patiënten met behulp van een ultrasnelle next generation sequencing (NGS)-benadering.