Bakteriofager (fager), vira, der inficerer bakterier, er en integreret bestanddel af tarmmikrobiomet. Selvom disse symbiotiske indbyggere driver bakteriel fitness og befolkningsdynamik, forstås der lidt om, hvordan de påvirker tarmhomeostase og sygdom. Denne protokol studerer isolerede T4-fager inden for en musemodel, der kan tilpasses andre fagbakteriepar.