マイクロアレイ実験のためのジベレラzeae子嚢胞子の生産とコレクション。
Summary
ジベレラzeaeの子のう胞子の発達過程を調べるために、無菌条件下でのコレクションのための手順は、プロトコル記述のための情報の最高レベルを生成するために撮影されている。これは、実験、完全なゲノム発現プロファイルのテストが実装されている重要な側面の再現性を促進すべきである。
Abstract
フザリウムgraminearumシュワーベ（teleomorphジベレラzeae）が作物の収量と穀物の品質を減らし、小麦と大麦で黒星病を引き起こす植物病原体です。 F. graminearumはまた、トウモロコシの茎や耳の腐敗の原因となり、穀物などを汚染し、ヒトや家畜（ゴスワミやキスラー、2004）に有害なトリコテセンなどのマイコトキシンの生産者です。菌類は胞子の2つのタイプを生成します。子のう胞子は、有性生殖によって生じる繁殖体は、一次感染の主な情報源です。これらの胞子は、強制的に成熟した子のう殻から排出し、風（フランツルら1999）によって分散される。二次感染は、主に植物の表面に無性手段によって生成される大分生子によって引き起こされます。この菌の子のう胞子の発達過程を調べるために、無菌条件下での大量の彼らのコレクションのための手順が必要でした。我々のプロトコルが理解し、再現性のための情報の最高レベルを生成するために撮影された、重要な側面の完全なゲノムの遺伝子発現プロファイルが生成され、解釈されている場合。特に、子嚢胞子の発芽と生物活性の変動は、材料の前の操作に依存しています。子嚢胞子の生産のすべてのステップを文書化するためのビデオの使用は、マイクロアレイ解析のためのますます厳しい要件に準拠する、標準化を高めるために提案されている。手順は、標準的な実験装置を必要とします。手順は、汚染及び子のう胞子の好意の時刻同期を防ぐために示されている。
Protocol
Discussion
ここで紹介するプロトコルは、フザリウム属に対してperithecial生産のために使用前の手続きに基づいています。 （Klittichとレスリー、1988;トレイルと共通、2000）。子のう胞子（マイクロアレイ解析のための十分な）大量のが生成されたことで手順の標準化は、実験の再現性が不可欠だ。それは環境要因、年齢と基板の違いは、子のう胞子の生物学的特性（ベイヤーとVerreet、2005）を変更できることが報告され…
Acknowledgements
著者は、優れた技術サポートのためにカレンヒルバーンに感謝。このプロジェクトは、米国農務省の共同国家研究、教育および拡張サービスの国立研究イニシアチブ（賞＃2004-35604-14327）によってサポートされていました。マティアスパスカリはブランコワイスフェローシップでサポートされています。米国の小麦と大麦スカブイニシアティブは、研究の継続的な支援のために認められている。
Materials
| Material Name | Tipo | Company | Catalogue Number | Comment |
|---|---|---|---|---|
| Petri dish 9 cm Diameter | Tool | |||
| Tween 60 (20%) | Reagent | |||
| Carrot agar (20% w/v organic carrots and 1.5% w/v agar) | Reagent |
Riferimenti
- Beyer, M., Verreet, J. A., Francl, L., Shaner, G., Bergstrom, G., Gilbert, J., Pedersen, W., Dill-Macky, R., Sweets, L., Corwin, B., Jin, Y., Gallenberg, D., Wiersma, J., Goswami, R. S., Kistler, H. C., Klittich, C. J. R., Leslie, J. F., Trail, F., Common, R., Tschantz, A. T., Horst, R. L., Nelson, P. E., Tschanz, A. T., Horst, R. K., Nelson, P. E. Germination of Gibberella zeae ascospores as affected by age of spores after discharge and environmental factors. Genetica. 118, 417-2013 (2005).
