Campionamento di acqua di mare e di raccolta
Summary
Questo video documenta i metodi per la raccolta di campioni di acqua marina costiera e il loro trattamento per varie applicazioni a valle compresa la concentrazione della biomassa, purificazione degli acidi nucleici, l'abbondanza delle cellule, nutriente e analisi gas tracciante.
Abstract
Questo video documenta i metodi per la raccolta di campioni di acqua marina costiera e il loro trattamento per varie applicazioni a valle compresa la concentrazione della biomassa, purificazione degli acidi nucleici, l'abbondanza delle cellule, nutriente e analisi gas tracciante. Per i campioni manifestazione di oggi sono stati raccolti dal ponte della HMS operativo John Strickland a Inlet Saanich. Un A-frame Derrick, con un multi-purpose verricello e sistema di cavi, viene usato in combinazione con Niskin o Go-Flo bottiglie di campionamento delle acque. Conducibilità, temperatura e profondità (CTD) sensori sono utilizzati anche per esempio la massa d'acqua sottostante. Per ridurre al minimo degassamento, campioni di gas traccia sono raccolti per primo. Poi, i nutrienti, chimica dell'acqua, e conta delle cellule sono determinate. Infine, le acque sono raccolte per la filtrazione delle biomasse. Il set-up e tempi di raccolta per un singolo getto è ~ 1,5 ore ad una profondità massima di 215 metri. Pertanto, per un totale di 6 ore è generalmente necessario a completare la serie di raccolta qui descritto.
Protocol
Discussion
In generale, c'è una grande quantità di preparazione e di pianificazione necessari per questo tipo di campionamento, in modo bilancio 2 giorni prima del viaggio per ottenere le cose in ordine e un giorno dopo, per la pulizia di tutto. In generale, non lasciare che l'acqua salata entrare in contatto con la pompa peristaltica o nel box in alluminio Zarges usato per trasportare l'attrezzatura campo. Trattare l'apparecchio con rispetto e che si esibirà anche per lungo tempo a venire.
Divulgazioni
The authors have nothing to disclose.
Acknowledgements
Vorremmo ringraziare la Fondazione canadese per l'innovazione, la British Columbia Fondo di conoscenza per lo sviluppo e la Nazionale di Scienze e Ingegneria Research Council (NSERC) del Canada per sostenere gli studi in corso sulle regioni di scarsità di ossigeno delle acque costiere oceaniche e aperto. Inoltre, DAW è stata sostenuta da borse di studio da NSERC, Killam e la fondazione TULA Centro finanziato per la diversità microbica e Evolution.
Materials
| Material Name | Tipo | Company | Catalogue Number | Comment |
|---|---|---|---|---|
| 20L Carboys | Fisher | 02-960-15 | ||
| 3/8″ Tygon | Cole Parmer | 06429-36 | ||
| Sterivex filters | Fisher | SVG010RS | ||
| Prefilter Housing Unit | AMD | 501200 | ||
| Luer Fitting | Cole Parmer | 31507-27 | ||
| 1/4″ Tygon tubing | Cole Parmer | 06429-24 | ||
| 1/4″ Tygon tubing | Cole Parmer | 06429-24 | ||
| 1/4″ Tygon tubing | Cole Parmer | 06429-24 | ||
| 50ml Plastic tubes | ||||
| Glass Serum Bottles | Glass Sample Collection | |||
| Septa and aluminum caps for glass serum bottles | ||||
| Hand Crimper | ||||
| 20-200ul Pipette and Tips | ||||
| Glass Tubes | Ammonium Sample Collection | |||
| 30ml Plastic Bottles | Nutrient Collection | |||
| Acrodisc Filters | Millipore | |||
| 5 ml Tubes | Nitrite Sample Collection | |||
| 37% Formaldehyde | Reagent | For cell count samples | ||
| 20% Zinc Acetate | Reagent | For sulfide samples | ||
| Mercuric Chloride | Reagent | For gas samples | ||
| milliQ water | Reagent | |||
| Ammonium Working Reagent | Reagent | Borate buffer, sodium sulfite, orthophaladialdehyde | ||
| Sulfanilamide | Reagent | 5g into 450ml water and 50ml HCl | ||
| N-(1-naphthy)-ethylenediamine dihydrochloride solution | Reagent | 0.5g into 500ml water |
Riferimenti
- Cline, J. D. Spectrophotometric determination of hydrogen sulfide in natural waters. Limnology & Oceanography. 14, 454-458 (1969).
- Holmes, R. M., Aminot, A., Kerouel, R., Hooker, B. A., Peterson, B. J. A simple and precise method for measuring ammonium in marine and freshwater ecosystems. Canadian Journal of fisheries and Aquatic Science. 56, 1801-1808 (1999).
