Back to chapter

8.1:

Base-pairing and DNA Repair

JoVE Core
Cell Biology
This content is Free Access.
JoVE Core Cell Biology
Base-pairing and DNA Repair

Lingue

Condividere

يشبه الـDNA سلّمًا ملتويًا. ودرجات سلّم الـDNA بمثابة أزواج مكمّلة من القواعد النيتروجينية. وفقًا لقواعد تشكيل الأزواج القاعدية،فإن أدنين،الذي هو بيورين،يقترن مع الثايمين،والذي هو بيريميدين،بواسطة رابطيتين هيدروجينيتين.كما يقترن غوانين،الذي هو بيورين،مع السايتوسين،الذي هو بيريميدين،بواسطة ثلاث روابط هيدروجينية. لكن لماذا تقترن البيورينات دائمًا مع البيريميدينات؟نتيجة إعاقات فراغية،يفرضها سكر الفوسفات الذي يشكل عماد الـDNA،لا يتوفر سوى 10.85 أنغستروم من الحيز للأزواج القاعدية في الحلزون المزدوج لـDNA. تكون بنية البيورينات على شكل حلقتين.لذلك فإن اثنين منها معًا أكبر من أن يتسع لهما هذا الحيز. وفي المقابل،إذا وضعنا بيريميدتين معًا،علمًا أن كل واحدة منهما تتألف من حلقة واحدة،فستكون المسافة بينهما أطول من أن تشكل روابط هيدروجينية،إذ يبلغ طولها قرابة 2 أنغستروم. لكن إذا زاوجنا بين بيورين وبيريميدين،يتلاءمان تمامًا مع الحيز المتوفر في حلزون الـDNA المزدوج ويكونان متقاربان بما يكفي لتشكيل روابط هيدروجينية.يمكن أن تتشكل الروابط الهيدروجينية عندما تكون ذرة هيدروجين على بعد 2 أنغستروم تقريبًا عن ذرة كهروسالبة،كالأكسجين والنيتروجين. يحتوي أدنين على ذرة هيدروجين واحدة قريبة من ذرة أكسجين وثايمين. ويحتوي الثايمين على ذرة هيدروجين واحدة قريبة من ذرة نيتروجين وأدنين.يؤدي هذا إلى تشكّل رابطتين هيدروجينيتين. لا يستطيع الأدنين أن يشكل روابط هيدروجينية مع السايتوسين،لأن السايتوسين يحتوي على ذرة هيدروجين في المكان الذي كان مخصصًا لذرتي الأكسجين والثايمين. كما أن ذرة الهيدروجين الموجودة في الثايمين،غائبة في السايتوسين.تحدث ظاهرة مشابهة في الزوج القاعدي المكون من الغوانين والسايتوسين حيث ذرة أكسجين في الغوانين،وذرتي أكسجين ونيتروجين في السايتوسين،تتمركز جميعها بعيدًا عن ذرة الهيدروجين،مما يؤدي إلى تشكيل ثلاث روابط هيدروجينية،وهذا لا يحدث في زوج الغوانين والثايمين. الخصوصية العالية للاقتران بين القواعد،ومساعدة إنزيمات تضاعف الـDNA،هو ما يجعل أدنين يقترن دائمًا مع ثايمين ويجعل غوانين يقترن دائمًا مع سايتوسين.

8.1:

Base-pairing and DNA Repair

مهدت قواعد إيروين شارغاف’ بشأن تكافؤ الـ DNA الطريق لاكتشاف الاقتران الأساسي في DNA. تنص قواعدشارغاف&#8217 على أنه في جزيء DNA مزدوج الشريطة ،

  1. كمية الأدينين (أ) تساوي كمية الثايمين (T)؛
  2. كمية الجوانين (G) تساوي كمية السيتوزين (C)؛ و
  3. مجموع البيورينات، A و G، يساوي مجموع البيريميدينات، C و T (أي A + G = C + T).

كشفت الأعمال اللاحقة التي قام بها واتسون وكريك أنه في الـ DNA المزدوج الشريطة، يشكل A دائماً رابطتين هيدروجينيتين مع T، ويشكل G دائماً ثلاث روابط هيدروجينية مع C.  يحافظ هذا الاقتران الأساسي على عرض ثابت للحلزون المزدوج للحمض النووي، حيث أن أزواج A-T و C-G هي 10.85Å في الطول ومتناسبة بدقة لتتواجد بين هياكل سكر-فوسفات.

تتسبب أزواج القواعد في عدم إمكانية الوصول إلى القواعد النيتروجينية للجزيئات الأخرى حتى تنفصل الروابط الهيدروجينية. ومع ذلك، يمكن لإنزيمات معينة كسر روابط الهيدروجين بسهولة لتنفيذ العمليات الخلوية الضرورية، مثل تكرار 10.85Å ونسخه. لأن زوج G-C لديه روابط هيدروجينية أكثر من  زوج A-T، DNA الذي يحتوي على نسبة عالية من أزواج G-C يحتاج إلى طاقة أعلى لفصل شريطين من الـ DNA أكثر من واحد يحتوي على نسبة متماثلة من أزواج A-T.

النظائر القاعدية كدواء

يعد الاقتران الصحيح للقاعدة أمراً ضرورياً للتكرار الصادق للـ DNA. نظائر القاعدة هي جزيئات يمكن أن تحل محل قواعد DNA القياسية أثناء تكرار DNA. هذه النظائر هي عوامل فعالة مضادة للفيروسات ومضادة للسرطان ضد أمراض مثل التهاب الكبد والهربس وسرطان الدم. آسيكلوفير ، المعروف أيضًا باسم آسيكلوجوانوزين، هو نظير أساسي للجوانين ويستخدم بشكل شائع في علاج فيروس الهربس البسيط  جزء الجوانين من أزواج الأسيكلوفير مرتبط مع الأدينين كالمعتاد أثناء تكرار الحمض النووي؛ ومع ذلك، لأنه لا يحتوي على نهاية 3’ النيوكليوتيد، لا يمكن لأنزيم بوليميراز DNA أن يستمر في تكوين أزواج قاعدية، وينتهي النسخ المتماثل.