Född Normalisering för fluorescens Optical Projection Tomography för hela hjärtat Imaging
Summary
Vi föreslår ett Born normaliserad strategi för Optical Projection Tomography (BnOPT) som svarar för upptaget egenskaper avbildas prover för att få korrekt och kvantitativa fluorescens tomografisk rekonstruktioner. Vi använder den föreslagna algoritmen för att rekonstruera fluorescens molekylär sonden distribution inom litet djur organ.
Abstract
Optisk projektion tomografi är en tredimensionell bildteknik som nyligen har införts som en avbildning verktyg främst i utvecklingsbiologi och gen studier uttryck. Tekniken gör biologiska prov optiskt transparent genom att först torkning dem och sedan placera i en blandning av bensylalkohol och bensylbensoat i förhållandet 2:1 (Babb eller Murray s Klar lösning). Tekniken gör biologiska prover optiskt transparent genom att först torkningen dem i graderade etanol-lösningar sedan placera dem i en blandning av bensylalkohol och bensylbensoat i förhållandet 2:1 (Babb eller Murray s Klar lösning) för att rensa. Efter clearingen spridningen bidrag i provet kan minskas väsentligt och gjort nästan försumbara medan absorptionen bidrag inte kan elimineras helt. När jag försöker rekonstruera fluorescens fördelning i urvalet som undersöks, påverkar detta bidrag de rekonstruktioner och leder oundvikligen till bild artefakter och fel kvantifiering .. Medan absorptionen kan minskas ytterligare med en varaktighet veckor eller månader i clearingen media kommer detta att leda till gradvis förlust av fluorescens och en orealistiskt lång prov handläggningstiden. Detta gäller när rekonstruera både exogena kontrastmedel (molekylära kontrastmedel) samt endogena kontrast (t.ex. rekonstruktioner av genetiskt uttryckt fluorescerande proteiner).
Protocol
Acknowledgements
C. Vinegoni erkänner stöd från National Institutes of Health (NIH) bevilja 1-RO1-EB006432.
Riferimenti
- Sharpe, J., Ahlgren, U., Perry, P., Hill, B., Ross, A., Hecksher-Sorensen, J., Baldock, R., Davidson, D. Optical projection tomography as a tool for 3D microscopy and gene expression studies. Science. 296, 541-544 (2002).
- Lee, K., Avondo, J., Morrison, H., Blot, L., Stark, M., Sharpe, J., Bangham, A., Coen, E. Visualizing plant development and gene in three dimensions using optical projection tomography. Plant Cell. 18, 2145-2156 (2006).
- Oldham, M., Sakhalkar, H., Wang, Y. M., Guo, P. Y., Oliver, T., Bentley, R., Vujaskovic, Z., Dewhirst, M. Three-dimensional imaging of whole rodent organs using optical computed and emission tomography. J. Biomed. Opt. 12, 1-10 (2007).
- Ntziachristos, V., Weissleder, R. Experimental three-dimensional fluorescence reconstruction of diffuse media by use of a normalized Born approximation. Opt. Lett. 26, 893-895 (2001).
