Küçük Kalpler Yarı-otomatik Optik Heartbeat Analizi
Summary
Biz yüksek hızlı optik kayıtları analiz etmek için geliştirilen bir Yarı-otomatik Optik Heartbeat Analiz yöntemi (Soha)<em> Drosophila</em> Zebrafish ve embriyonik fare kalpleri. Biz meyve sineği ve embriyonik fare kalpleri kalp fonksiyonu analizi metodolojisi uygulama göstermektedir.
Abstract
Biz yüksek hızlı optik kayıtları analiz etmek için bir yöntem geliştirdi.<em> Drosophila</em> Zebrafish ve embriyonik fare kalpleri (Fink, et al, 2009). Yarı-otomatik Optik Heartbeat Analizi (Soha), bireysel kasılma ve gevşeme olayları ile ilişkili kalp hareketleri algılamak için bir roman hareket algılama algoritması kullanır. Program bir dizi fizyolojik sistolik ve diyastolik aralıklarla, kalp hızı, kalp atışı arrhythmicity yanı sıra kalitatif ve kantitatif tedbirler de dahil olmak üzere ilgili okuma sağlar. Program ayrıca, fraksiyonel kısalma ve fraksiyonel alan değişiklikleri hesaplanır diyastol ve sistol sırasında kalp çap ölçümleri hesaplar. Çıkış, çoğu elektronik tablo programları ile uyumlu bir dijital dosya olarak verilmiştir. Ölçümler, her kalp atışı için rekor bir istatistik çıktı gücünün artırılması yapılır. Biz her kullanıcı girişi için gerekli olan adımları göstermek ve her üç genetik olarak izlenebilir kalp modelleri kalp fonksiyonlarının analizi metodolojisi uygulama göstermektedir.
Protocol
Discussion
Drosophila modeli embriyolojik gelişim öğrenme ve hafıza arasında değişen çeşitli bilimsel soruları gidermek için kullanılan güçlü bir genetik bir araç olduğu kanıtlanmıştır. Son zamanlarda bu çok yönlü bir model organizmanın genetik kalp fonksiyonlarının araştırmak için kullanılmaktadır. Yetişkin Drosophila kalp fizyolojisi ölçmek için bir dizi girişimi sağlam sineklerin karın manikür yoluyla yapılan gözlemlere dayanıyordu. Bu yaklaşımların çoğu, tek bir parametre, kalp h…
Divulgazioni
The authors have nothing to disclose.
Acknowledgements
KO ve AC, Amerikan Kalp Birliği hibe ve bir burs tarafından desteklenmektedir. SIB ve RB NIH hibe ile desteklenmektedir.
Materials
| Material Name | Tipo | Company | Catalogue Number | Comment |
|---|---|---|---|---|
| MatLab software | Math Works, Inc | Required environment for the analysis software. | ||
| EM-CCD digital camera | Hamamatsu Corp. | 9100 or 9300 | Other high speed digital cameras will also work. | |
| HC image data capture software | Hamamatsu Corp. | Other image capture software that produces movies in avi format will also work. | ||
| Light Microscope with 10x objective | Leica | A dipping lens that eliminates the air water interface greatly improves resolution |
Riferimenti
- Cammarato, A., Dambacher, C. M., Reedy, M. C., Knowles, A. F., Kronert, W. A., Bodmer, R., Ocorr, K., Bernstein, S. I. Myosin Transducer mutations differentially affect motor function, myofibril structure, and the performance of skeletal and cardiac muscles. Mol Biol Cell. 19 (2), 553-562 (2008).
- Ocorr, K., Reeves, N., Wessells, R. J., Fink, M., Chen, H. -. S. V., Akasaka, T., Yasuda, S., Metzger, J., Giles, W., Posakony, J. W., Bodmer, R. KCNQ potassium channel mutations cause cardiac arrhythmias in Drosophila that mimic the effects of aging. Proc Natl Acad Sci U S A. 104, 3943-3948 (2007).
- Fink, M., Callol-Massot, C., Chu, A., Ruiz-Lozano, P., Izpisua Belmonte, J. C., Giles, W., Bodmer, R., Ocorr, K. A new method for the detection and quantification of heartbeat parameters in Drosophila, zebrafish and embryonic mouse hearts. Biotechniques. 46, 101-113 (2009).
