Semiautomatici Analisi Heartbeat ottica di piccoli cuori
Summary
Abbiamo sviluppato un semi-automatico ottica Metodo di analisi Heartbeat (SoHa) per analizzare le registrazioni ottico ad alta velocità da<em> Drosophila</em>, Zebrafish e cuori embrionali di topo. Dimostriamo l'applicazione della nostra metodologia per l'analisi della funzione cardiaca nel moscerino della frutta e cuori embrionali di topo.
Abstract
Abbiamo sviluppato un metodo per analizzare le registrazioni ottico ad alta velocità da<em> Drosophila</em>, Zebrafish e cuori embrionali di topo (Fink, et. Al., 2009). Il nostro semi-automatico Analisi Heartbeat (Optical SoHa) utilizza un nuovo algoritmo di rilevamento di movimento che è in grado di rilevare movimenti di contrazione cardiaca associata a singoli eventi e relax. Il programma prevede una serie di letture fisiologicamente rilevanti tra pressione sistolica e diastolica intervalli, frequenza cardiaca, come pure le misure qualitative e quantitative di arrhythmicity battito cardiaco. Il programma calcola anche le misure di diametro cuore sia durante la diastole e sistole dal quale sono calcolati frazione di accorciamento e cambia zona frazionaria. L'uscita è fornito sotto forma di file digitale compatibile con la maggior parte dei programmi di foglio elettronico. Le misure sono fatte per ogni battito cardiaco in un record aumentando la potenza statistica del risultato. Dimostriamo ciascuna delle fasi in cui è richiesto l'input dell'utente e mostra l'applicazione della nostra metodologia per l'analisi della funzione cardiaca in tutti e tre i modelli cuore geneticamente trattabili.
Protocol
Discussion
Il modello Drosophila ha dimostrato di essere un potente strumento genetico che è stato usato per affrontare una serie di quesiti scientifici che spaziano dallo sviluppo embrionale all'apprendimento e alla memoria. Di recente questo organismo modello versatile è stato utilizzato per studiare la genetica della funzione cardiaca. Un certo numero di tentativi di quantificare fisiologia cardiaca in adulti Drosophila si sono basati sulle osservazioni fatte nei moscerini intatta attraverso la cuticola addominale. La mag…
Divulgazioni
The authors have nothing to disclose.
Acknowledgements
KO e AC sono supportati da una borsa e una borsa di studio della American Heart Association. SIB e RB sono sostenuti da sovvenzioni NIH.
Materials
| Material Name | Tipo | Company | Catalogue Number | Comment |
|---|---|---|---|---|
| MatLab software | Math Works, Inc | Required environment for the analysis software. | ||
| EM-CCD digital camera | Hamamatsu Corp. | 9100 or 9300 | Other high speed digital cameras will also work. | |
| HC image data capture software | Hamamatsu Corp. | Other image capture software that produces movies in avi format will also work. | ||
| Light Microscope with 10x objective | Leica | A dipping lens that eliminates the air water interface greatly improves resolution |
Riferimenti
- Cammarato, A., Dambacher, C. M., Reedy, M. C., Knowles, A. F., Kronert, W. A., Bodmer, R., Ocorr, K., Bernstein, S. I. Myosin Transducer mutations differentially affect motor function, myofibril structure, and the performance of skeletal and cardiac muscles. Mol Biol Cell. 19 (2), 553-562 (2008).
- Ocorr, K., Reeves, N., Wessells, R. J., Fink, M., Chen, H. -. S. V., Akasaka, T., Yasuda, S., Metzger, J., Giles, W., Posakony, J. W., Bodmer, R. KCNQ potassium channel mutations cause cardiac arrhythmias in Drosophila that mimic the effects of aging. Proc Natl Acad Sci U S A. 104, 3943-3948 (2007).
- Fink, M., Callol-Massot, C., Chu, A., Ruiz-Lozano, P., Izpisua Belmonte, J. C., Giles, W., Bodmer, R., Ocorr, K. A new method for the detection and quantification of heartbeat parameters in Drosophila, zebrafish and embryonic mouse hearts. Biotechniques. 46, 101-113 (2009).
