Method Article

Indagare tessuti e risposte fitocromo organo-specifici utilizzando FACS-Cell-assistita di tipo profili specifici di espressione in Arabidopsis thaliana

DOI:

10.3791/1925

May 29th, 2010

In This Article

Summary

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Le basi molecolari delle risposte fitocromo spazio-specifica è indagato con le piante transgeniche che presentano tessuti e carenze fitocromo organo-specifiche. L'isolamento di cellule specifiche esporre indotte esaurimento fitocromo cromoforo da Fluorescence-Activated cella Ordinamento seguita da analisi di microarray viene utilizzata per identificare i geni coinvolti nello spazio-risposte specifiche fitocromo.

Abstract

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Media luce una serie di processi evolutivi e adattativi per tutto il ciclo di vita di una pianta. Le piante utilizzano la luce di assorbimento delle molecole chiamate fotorecettori di senso e di adattarsi alla luce. Il rosso / lontano-rosso che assorbono la luce fotorecettori fitocromo sono stati studiati ampiamente. Fitocromi esistere come una famiglia di proteine ​​con funzioni diverse e sovrapposte in tutti i sistemi vegetali superiori in cui sono stati studiati

Protocol

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1. Crescita delle piante

  1. Confermato UAS-BVR GAL4 X-GFP linea trappola enhancer isolato come descritto 4 (per sintesi vedi fig. 1) e le linee di wild-type o parentale vengono seminate sul terreno, ovvero ~ 2000 semi sterilizzati per riga.
  2. Le piante sono coltivate per 5 settimane in terra sotto illuminazione bianca di 100 μmolm -2 s -1 a 22 ° C e 70% di umidità.

2. Foglia di protoplasti di isolamento (adattato da Denecke e Vitale 9)

  1. Per isolare protoplasti, preparare TEX buffer. Per buffer di 1 litro TEX, pesare i seguenti componenti: 3,1 g Gamborg di sali B5,....

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Discussion

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Profili di espressione genica attraverso microarray (1) ha indicato che oltre il 30% dei geni in piantine di Arabidopsis sono regolati luce 11 e (2) ha identificato un vasto gruppo di geni che codificano le proteine ​​luce di trasduzione del segnale coinvolte nella cascata di segnalazione fitocromo 12, 13 . Tali esperimenti suggeriscono che la luce induce cambiamenti rapidi e lungo termine espressione genica. Ogni pool di fitocromi può controllare solo un sottoinsieme di risposte di sviluppo e di a.......

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Acknowledgements

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Lavoro in laboratorio Montgomery sulle risposte fitocromo nelle piante è sostenuta dalla National Science Foundation (non concede. MCB-0919100 per BLM) e Scienze Chimiche, Scienze geologiche e Bioscienze Divisione, Ufficio di Basic Sciences Energy, Office of Science, US Department of energia (non concedere alcuna. DE FG02 91ER20021 a BLM). Ringraziamo Melissa Whitaker per l'assistenza tecnica durante le riprese e la lettura critica del manoscritto, Stephanie Costigan sperimentale per l'assistenza, il Dott. Luigi Re di assistenza sviluppare e ottimizzare le Fluorescence-Activated cella ordinamento protocolli per l'ordinamento di protoplasti di Arabidopsis ....

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Materials

List of materials used in this article
NameCompanyCatalog NumberComments
Anticorpo anti-BVRQED Bioscience Inc.56257-100
Cellulasi “ Onozuka” R-10SERVA ElettroforesiMSPC 0930
Gamborg' s Miscela di sali basali B5Sigma-AldrichG5768
Macerozyme R-10SERVA ElettroforesiPTC 001
MES, basso contenuto di umiditàSigma-AldrichM3671
Sali di Murashige e SkoogCaisson Laboratories74904
PhytablendCaisson Laboratories28302
RNeasy Plant MinikitQiagen16419

References

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  1. Franklin, K. A., Quail, P. H. Phytochrome functions in Arabidopsis development. J. Exp. Bot. 61, 11-24 (2010).
  2. Montgomery, B. L. Right place, right time: Spatiotemporal light regulation of plant growth and development. Plant Signal Behav. 3, ....

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Phytochrome ResponsesFACS AssistedCell Type SpecificGene Expression ProfilingArabidopsis thalianaFluorescence Activated Cell SortingProtoplast IsolationConfocal MicroscopyRNA ExtractionMicroarray Analysis

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