Summary

자기편 및 비 점착 성의 포유 동물 세포의 현장 Subcellular 분별 (분리)에서

Published: July 23, 2010
doi:

Summary

현미경 coverslips에서 포유 동물 세포의 현장 subcellular 분별 (분리)에서 단백질 지방화의 시각이 있습니다.

Abstract

단백질 기능을 속속들이 단백질 현지화로 결합됩니다. 어떤 단백질은 특정 위치 또는 subcellular 구획로 제한하고 있지만, 많은 단백질이 밀접하게 특정 subcellular 도메인 또는 구조와 관련된 하위 인구를 무료로 교환 자유롭게 diffusing 인구로 존재한다. 원위치 subcellular 분별 (분리)에서의 시각화가 가능 단백질 compartmentalization 또한 단백질 구체적인 구조에 집중 하위 인구를 공개하실 수 있습니다. 예를 들어, 용해 세포질 단백질과 느슨하게 개최 핵 단백질의 제거는 염색질와 함께 전사 요소의 안정적인 연결을 확인할 수 있습니다. DNA의 소화 이후 어떤 경우에는 집합 핵 발판이나 핵 매트릭스를 칭했다는 단백질과 RNAS의 네트워크 연결을 확인할 수 있습니다.

여기 현미경 coverslips에 자기편 및 비 점착 성의 포유 동물 세포의 현장 분별화에서 중 필요한 단계를 설명합니다. 단백질 시각화는 특정 항체 또는 형광 융합 단백질과 형광 현미경을 사용하여 얻을 수 있습니다. 항체 및 / 또는 특정 구획이나 구조에 대한 마커 역할을 형광 염료는 단백질 지방화는 자세히 매핑 될 수 있습니다. 원위치 분별화에서도 서양 각 분획에있는 단백질의 양을 비교 모래 바닥과 함께하실 수 있습니다. 이 간단한 생화 학적 접근 방법은 별도로 들키지 않고 남아있는 것이 연결을 확인할 수 있습니다.

Protocol

분류에 대한 I. 준비 이 섹션은 폴리 – L – 라이신 코팅 현미경 coverslips 및 분류하기 전에 세포의 첨부 파일의 준비를 설명합니다. 필요한 경우 전지 transiently 첨부 앞 또는 뒤에 하나 단백질 발현 벡터와 함께 transfected 수 있습니다. 폴리 – L – 라이신 코팅 coverslips의 A. 준비 증류수에 1mg/ml 폴리 – L – 라이신의 솔루션을 준비합니다. 22 락을 플랫…

Discussion

일반적인 문제 및 제안 :

전부 또는 세포의 대부분은 세척하는 동안 손실됩니다. 세척 단계를하는 동안 액체는 coverslip을 피하 6 잘 접시의 측면으로 천천히 추가해야합니다. 마찬가지로 액체는 신중하게 틸팅 판에 의해 제거되어야하며 천천히 초과 액체를 pipetting. 세포 접착은 폴리 – L – 라이신 코팅 coverslips을 사용하여 증가 수 있습니다.

게놈 DNA가 완전?…

Divulgazioni

The authors have nothing to disclose.

Acknowledgements

Anyaporn Sawasdichai 및 Nazefah 압둘 하미드는 박사에 대한 각각 로얄 태국 정부와 말레이시아 정부에 감사 장학금. 이 작품은 PSJ와 KG에게 수여 웰컴 트러스트 프로젝트 부여하여 자금을했습니다. 우리는 또한 브리스톨 울프슨의 Bioimaging 시설의 대학에 감사하고 있습니다.

Materials

Material Name Tipo Company Catalogue Number Comment
BSA Chemical Sigma A9647-100G  
DNase I Chemical Sigma DN25-1G  
poly-L-Lysine Chemical Sigma P-8920  
Trypsin Chemical      
EGTA Chemical Sigma E4378-25G  
Fomaldehyde Chemical BDH 284216N  
PIPES Chemical Sigma P-6757  
Sucrose Chemical Fisher Scientific S/8600/53  
Triton X-100 Chemical Sigma T-6876  
Mounting Medium with DAPI Chemical Vector Laboratories H-1200  
Fugene 6 Transfection Reagent Chemical Roche 11814443001  
Histone H1 Antibodies Santa Cruz SC-8030  
Lamin A/C Antibodies Santa Cruz SC-20681  
Tubulin-α Antibodies Santa Cruz SC-32293  

Riferimenti

  1. Donaldson, M. M., Boner, W., Morgan, I. M. TopBP1 regulates human papillomavirus type 16 E2 interaction with chromatin. J Virol. 81, 4338-4342 (2007).
  2. Javed, A., Guo, B., Hiebert, S., Choi, J. Y., Green, J., Zhao, S. C., Osborne, M. A., Stifani, S., Stein, J. L., Lian, J. B., van Wijnen, A. J., Stein, G. S. Groucho/TLE/R-esp proteins associate with the nuclear matrix and repress RUNX (CBF(alpha)/AML/PEBP2(alpha)) dependent activation of tissue-specific gene transcription. J Cell Sci. 113, 2221-2231 (2000).
  3. Kowalczyk, A. M., Roeder, G. E., Green, K., Stephens, D. J., Gaston, K. Measuring the induction or inhibition of apoptosis by HPV proteins. Methods Mol. Med. 119, 419-432 (2005).
  4. McLarren, K. W., Theriault, F. M., Stifani, S. Association with the nuclear matrix and interaction with Groucho and RUNX proteins regulate the transcription repression activity of the basic helix loop helix factor Hes1. J Biol. Chem. 276, 1578-1584 (2001).
  5. McNeil, S., Guo, B., Stein, J. L., Lian, J. B., Bushmeyer, S., Seto, E., Atchison, M. L., Penman, S., van Wijnen, A. J., Stein, G. S. Targeting of the YY1 transcription factor to the nucleolus and the nuclear matrix in situ: the C-terminus is a principal determinant for nuclear trafficking. J Cell Biochem. 68, 500-510 (1998).
  6. Melan, M. A., Sluder, G. Redistribution and differential extraction of soluble proteins in permeabilized cultured cells. Implications for immunofluorescence microscopy. J Cell Sci. 101, 731-743 (1992).
  7. Zou, N., Lin, B. Y., Duan, F., Lee, K. Y., Jin, G., Guan, R., Yao, G., Lefkowitz, E. J., Broker, T. R., Chow, L. T. The hinge of the human papillomavirus type 11 E2 protein contains major determinants for nuclear localization and nuclear matrix association. J. Virol. 74, 3761-3770 (2000).
check_url/it/1958?article_type=t

Play Video

Citazione di questo articolo
Sawasdichai, A., Chen, H., Abdul Hamid, N., Jayaraman, P., Gaston, K. In situ Subcellular Fractionation of Adherent and Non-adherent Mammalian Cells. J. Vis. Exp. (41), e1958, doi:10.3791/1958 (2010).

View Video