A fim de examinar a expressão gênica no tecido da asa pupal de Bicyclus anynana, apresentamos um protocolo otimizado para em hibridizações in situ usando riboprobes. Nós também fornecemos diretrizes para a otimização deste protocolo para o uso em asas pupal das espécies de Lepidoptera outros.
Abstract
Apresentamos aqui, em formato de vídeo, um protocolo para a hibridizações in situ nas asas pupal do Bicyclus borboleta anynana usando riboprobes. Em hibridizações in situ, um dos pilares da biologia do desenvolvimento, são úteis para estudar os padrões espaciais e temporais da expressão gênica no desenvolvimento de tecidos ao nível da transcrição. Se os anticorpos que alvejam os produtos de proteína de transcrição de genes ainda não foram desenvolvidos, e / ou existem múltiplas cópias do gene de uma proteína específica no genoma que não podem ser diferenciados utilizando anticorpos disponíveis, em situs pode ser usado em seu lugar. Enquanto um in situ para discos asa larval tem sido disponibilizados para a comunidade de borboletas por vários anos, o atual protocolo foi optimizado para as asas maiores e mais frágeis pupal.
Protocol
DIA 1 Prepare as seguintes soluções: PBS 10x 1x PBS 1x PBT 2 O DDH Adicionar DEPC 0,1% para volume total e agitar soluções vigorosamente. Autoclave. Fix paraformaldeído 4% – usando PBS-DEPC Proteinase K solução – se precipitar está presente vortex, vigorosamente antes de retirar alíquota Tampão de digestão Parar Tampão Prehybridization 50:50 PBT: Buffer Prehybridization …
Discussion
Otimização dos protocolos existentes
Em hibridizações in situ em discos asa larval foram realizados com sucesso usando os discos de borboletas Precis coenia (Carroll et al, 1994;. Keys et al 1999;. Weatherbee et al 1999).. O protocolo atual foi adaptado de um protocolo detalhado disponíveis mediante solicitação por escrito do Laboratório Carroll para colorações asa larval. As mudanças que fizemos servem para acomodar as diferenças entre os tecidos asa de larva e pupa. Durante pupal dissecções asas posteriores, a membra…
Acknowledgements
Agradecemos a Jayne Selegue, Margaret Hollingsworth, Jin Berry, Ryo Futahashi, Najmus Sahar Mahfooz, Aleksandar Popadic, Bob Reed, Roche suporte técnico para ajudar na resolução deste protocolo. Agradecemos também a William Piel para aconselhamento sobre a edição do filme.
Materials
Material Name
Tipo
Company
Catalogue Number
Comment
Fix Buffer
4% Paraformaldehyde in PBS
PBT
0.1% Tween 20 in PBS
Proteinase K solution
2.5g/ml Proteinase K in PBT
Digestion Stop Buffer
2 mg/ml glycine in PBT
Pre-Hybridization Buffer
For 50 ml PHB: 12 ml DEPC treated water + 25 ml Formamide + 12.5 ml 20 x SSC + 50 ul Tween 20 + 500 ul 10 mg/ml salmon sperm (Rnase free, heat denatured prior to addition to solution).
Hybridization Buffer
Add 1 mg/ml glycogen to prehybridization buffer
Block Buffer
50 mM Tris pH 6.8, 150 mM NaCl, 0.5% IGEPAL (NP40), 5 mg/ml BSA