2012: год в обзоре

Summary

Вот посмотрите на некоторые этапы и основные моменты 2012 года в журнале Визуализированные Эксперименты (Юпитера).

Abstract

Here’s a look at some of the milestones and highlights of the year 2012 in Journal of Visualized Experiments (JoVE).

At the start of 2012, JoVE reached a major milestone by publishing our 1500th article. In this publication, in JoVE Bioengineering, Yu et al. described a method for analyzing the free radical composition of cigarette smoke. This method simulated cigarette puffing with a single-port smoking device, and combined it with electron spin resonance (ESR) spectroscopy to measure the degree to which antioxidant compounds can scavenge free radicals in cigarette smoke. A possible outcome of this research is the creation of less harmful cigarettes.

JoVE Bioengineering also contained the most-viewed article of 2012. Owczarczak et al. described a method for hacking a standard inkjet printer, loading ink cartridges with a cell-suspension “bioink,” and printing lines of live cells onto glass slides. The thermal inkjet printing process creates temporary pores in the cell membrane, visualized by the incorporation of fluorescently labeled actin monomers. This concept, called “bioprinting,” has many potential applications in cell and tissue engineering.

Also in 2012, JoVE Bioengineering featured a protocol by Hsia et al. for isolating and purifying spider silk protein, spinning it into fibers, and assessing the fiber strength. This protocol for laboratory-scale production of spider silk, which is stronger than tensile steel, can potentially be extended to large-scale manufacturing.

In JoVE Clinical and Translational Medicine, we featured a number of articles related to stroke, one of which. In one article, Möbius-Winkler et al. demonstrated placement of the WATCHMAN left atrial appendage occlusion device from Boston Scientific. This device is designed to prevent strokes by trapping clots within the left atrial appendage of the heart before they exit. Our authors demonstrated how to insert the guide wire through the femoral artery into the heart, advance the device into the left atrium, and deploy the device in the left atrial appendage.

Another article focused on stroke, Hamel et al. described the use of a driving simulator to study how patients compensate for visual field defects following stroke. By analyzing the compensatory gaze behavior of patients as they navigated through virtual driving courses with varying degrees of complexity, our authors see great potential for the use of driving simulators in stroke rehabilitation.

In JoVE Immunology and Infection, we published an article by Keyel et al. describing the real-time kinetics of immune cell responses to bacterial toxins using live cell microscopy. Combined with high-speed 3D confocal microscopy, this technique can also visualize the cellular repair response.

Also in JoVE Immunology and Infection, we featured an article by Yap et al. describing methods for diagnosing helminth infections in children. Helminths are parasitic worms that can infect the intestinal tract of humans and animals, and may be distinguished based on their morphology. The same article demonstrated how to measure the impact of helminth infections on physical fitness in children, which is a measure of overall health.

In JoVE Neuroscience, we featured a method by Hoffmann et al., who used tiny headphones to alter the auditory feedback in songbirds, and analyzed the computational and neurophysiological basis of vocal learning in birds when they adjust their singing in response to altered acoustic signals.

Also in JoVE Neuroscience, we moved from birds to bees with a method that assesses associative and non-associative tactile learning in honeybees. This method, by Mujagić et al., allowed bees to scan different metal surfaces with their antennae, then conditioned them to expect sugar water when their antennae touched particular surfaces, and analyzed the corresponding changes in antennal movement.

In 2012, we launched a brand-new section: JoVE Applied Physics, which features articles on subjects ranging from plasma physics to material science. The Applied Physics section also contained JoVE’s 2000th video article, filmed in a synchrotron radiation facility, where Borisenko et al. showed how to determine the electronic structure of complex materials using angle-resolved photoemission spectroscopy.

In the JoVE General section, we published an article by Artioli et al. demonstrating the use of a portable gas analyzer to measure oxygen consumption during complex exercise – such as judo. By analyzing oxygen consumption and collecting blood for measuring plasma lactate concentration, this method can determine the relative contributions of different energy systems to specific aspects of complex exercise.

Finally, JoVE followed Dolhi et al. to a permanently ice-covered saline lake in Antarctica. There, scientists drilled through the ice to study single-celled microorganisms called protists that live in the harsh conditions of Antarctica.

This Year in Review was just a brief glimpse of a few of over 600 video articles that JoVE offered in 2012. Browse the JoVE archives to see thousands of other videos, and stay tuned for what’s coming up this year in JoVE: The Journal of Visualized Experiments.

Protocol

Протокол для обнаружения и очистки газовой фазе Свободные радикалы в дыме сигарет Длинный-Си Ю. 1, Борис Григорьевич Dzikovski 2, Jack H. Фрид 3, 2 1 CDCF-AOX Lab, 2 национальных биомедицинских Центр перспективных технологий ESR (ACERT), Отделение химии и химической биологии Корнельского университета, 3 ACERT исследований, Центр Отделения химии и химической биологии, Baker лаборатории Корнельского университета Спин-захвата ЭПР-спектроскопии был использован для изучения влияния растительных антиоксидантов ликопин, пикногенол и экстракт косточек винограда по вывозу мусора газовой фазы свободные радикалы в сигаретном дыме. Сторож левого предсердия устройства Закрытие придатком фибрилляции предсердий Sven Мебиуса Wi-nkler, Маркус Сандри, Норман Mangner, Филипп Лурц, Инго Dähnert, Герхард Schuler Лейпцигский университет Центр сердца В сопроводительном видео описывает процедуру для чрескожного размещения сторож ушка левого предсердия (УЛП) устройства. Сторож это устройство нитинола предназначены для хронически вживленными в, или чуть дистальнее, открытие ушка левого предсердия (УЛП) для улавливания тромбов, прежде чем выйти из LAA, предотвращение тромбоэмболических инсульта. Определение Вклад Energy Systems во время тренировки Гильерме Г. Artioli 1, Ромуло C. Бертуцци 2, Hamilton Roschel 1, 3, Сандро Х. Мендес 1, Антонио Х. Lancha младший 1, Emerson Franchini 4 1 Лаборатория прикладной питания, школа физического воспитания и спорта, университетыти Сан-Паулу, 2 аэробных Group Research Performance, школа физического воспитания и спорта, Университета Сан-Паулу, 3 Лаборатория нервно-мышечной адаптации к силовой тренировки, школа физического воспитания и спорта, Университета Сан-Паулу, 4 боевых искусств и спортивных единоборств Research Group, Школа физического воспитания и спорта, Университета Сан-Паулу Этот протокол позволяет Исследователи сосредоточились на физические упражнения и спортивные наук для определения относительного вклада из трех различных энергетических систем в общем объеме расходов энергии во время большого разнообразия упражнений. Создание микробных культур эукариотических Обогащение из химически стратифицированных озер Антарктики и оценки углеродного потенциала фиксации Дженна М. Dolhi, Николай Ketchum, Рэйчел М. Морган-Kiss Кафедрой микробиологии, Майами University Микробная эукариот являются источником фотосинтеза полученных углерода и верхней хищных видов в постоянно покрытых льдом озер Антарктики. В этом докладе описывается подход обогащение культуры, чтобы изолировать метаболически универсальный эукариот микробной из Антарктики озеро, озеро Бонни, и оценивает потенциальные неорганических фиксации углерода с использованием радиоизотопного анализа для рибулозо-1 ,5-bisphophate карбоксилазы оксигеназы (RUBISCO) деятельности. Синтетического шелка паука производства в лабораторных условиях Ян Ся, Эрик Gnesa, Райан Пачеко, Кристина Келер, Felicia Джеффри Крейг Vierra Отделение биологических наук, Тихоокеанский университет Несмотря на выдающиеся механические и биохимические свойства шелка паука, этот материал не может быть собран в больших количествах с помощью обычных средств. Здесь мы по убываниюRibe эффективной стратегии вращаться искусственных шелковых волокон паука, который является важным процессом для следователей изучения паук производства шелка и их использование в качестве следующего поколения биоматериалов. Определение передаваемые через почву гельминтами статус-инфекции и физической подготовленности детей школьного возраста Peiling Yap 1, 2, Томас Fürst 1, 2, Иван Мюллер 1, 2, Susi Kriemler 1, 2, Юрга Utzinger 1, 2, Петр Steinmann 1, 2 1 Отдел эпидемиологии и общественного здоровья, швейцарский тропический и институт общественного здравоохранения, Базель, Швейцария, 2 Базельский университет, Базель, Швейцария Хроническая инфекция, передаваемыми через почву гельминтами (STHs) вызывает нарушение всасывания, задержка роста, и тратить на растущего ребенка. Таким образом, вполне вероятно, что эти инфекции также уменьшить физикеческих фитнес для детей. Здесь мы представляем два метода для диагностики STHs и 20-метровый челночный бег тестов для оценки физического детей. Вождение Моделирование в клинике: проверки остроты исследовательское поведение в повседневной деятельности жизни пациентов с дефектами поля зрения Johanna Hamel 1, 2, Антье Kraft 1, Sven Ohl 3, Софи Де Beukelaer 1, Генриха Дж. AUDEBERT 1, 2, Стефан А. Брандт 1 1 Кафедра неврологии, Universitätsmedizin Charité, 2 центра ход исследований Berlin (CSB), Universitätsmedizin Charité, 3 Берлинской школы психики и мозга, Humboldt Universität Berlin цу Пациенты с визуальным дефицит после инсульта отчет о различных ограничений в повседневной жизни, скорее всего, из-за переменнойкомпенсаторные стратегии, которые трудно дифференцировать в клинической практике. Мы представляем клинический настройки, который позволяет измерение различных компенсационных головы и движения глаз стратегий и оценки их влияния на ходовые качества. Визуализация бактериальный токсин индуцированные ответы с помощью флуоресцентной микроскопии Онлайн сотовых Петр Алексеевич Keyel 1, Мишель Е. Heid 1, Simon C. Watkins 2, Russell D. Salter 1 1 Кафедра иммунологии, Университет Питтсбурга школа медицины, 2 отдела клеточной биологии и физиологии Университета Питтсбурга школа медицины Методы очистки холестерина обязательного токсина стрептолизин O из рекомбинантной E. палочки и визуализации связывания токсинов жить эукариотических клеток описаны. Локализованные доставки токсина яnduces быстрые и сложные изменения в целевые клетки раскрывая новые аспекты токсина биологии. Фотоэмиссии с угловым разрешением спектроскопии при сверхнизких температурах Сергей В. Борисенко 1, Владимир Б. Zabolotnyy 1, А. В. Kordyuk 1, 2, Данил В. Evtushinsky 1, Тимур К. Ким 1, 3, Emanuela Carleschi 4, Брайан Дойл П. 4, Rosalba Фиттипальди 5, Марио Cuoco 5, Антонио Vecchione 5, Хельмут Бергер 6 1 Институт твердого Государственный научно-исследовательский, IFW-Dresden, 2 Институт физики металлов Национальной академии наук Украины, 3 Diamond Light Source LTD, 4, физический факультет Университета Йоханнесбурга, 5 CNR-SPIN, и Dipartimento ди Fisica "ER Caianiello ", Università ди Салерно, 6 ИнститутФизика сложный вопрос, Федеральной политехнической школе Лозанны Основная цель этого метода состоит в определении низких энергий электронной структуры твердых тел при сверхнизких температурах с помощью фотоэмиссии с угловым разрешением спектроскопии с синхротронного излучения. Легкий, наушники-администратора системы для управления Звуковая обратная связь в Певчие птицы Лукас А. Гофмана 1, 2, Конор W. Kelly 1, 3, David A. Nicholson 1, 2, Samuel J. Sober 1 1 Отдел биологии, Университет Эмори, 2 Neuroscience Graduate Program, Университет Эмори, 3 программы в неврологии и поведенческой биологии университета Эмори Мы описываем проектирование и монтаж миниатюрные наушники подходят для замены природного слуховой обратной связи певчих птиц вс манипулировать звуковой сигнал. Интернет аппаратной обработки звука используется для манипулирования песни продукции, внедрению в режиме реального времени ошибки в слуховой обратной связи через наушники, и вести вокальное обучение двигателя. Тактильные кондиционирования и анализа движения усиков стратегии отбора проб в медоносных пчел (Apis MELLIFERA L.) Самир Mujagic, Саймон Майкл Вюрт, Свен Hellbach, Фолькер Dürr Биологическая кибернетика, CITEC – Когнитивные технологии взаимодействия – Центр повышения квалификации, Университет Билефельда В этом протоколе мы покажем, как условие использованы медоносных пчел на тактильные раздражители и ввести 2D техники захвата движения для анализа кинематики мелкомасштабных усиков модель выборки.