2012: Un año en revisión

Summary

He aquí un vistazo a algunas de las etapas y aspectos destacados del año 2012 en la revista Journal of experimentos visualizados (Jove).

Abstract

Here’s a look at some of the milestones and highlights of the year 2012 in Journal of Visualized Experiments (JoVE).

At the start of 2012, JoVE reached a major milestone by publishing our 1500th article. In this publication, in JoVE Bioengineering, Yu et al. described a method for analyzing the free radical composition of cigarette smoke. This method simulated cigarette puffing with a single-port smoking device, and combined it with electron spin resonance (ESR) spectroscopy to measure the degree to which antioxidant compounds can scavenge free radicals in cigarette smoke. A possible outcome of this research is the creation of less harmful cigarettes.

JoVE Bioengineering also contained the most-viewed article of 2012. Owczarczak et al. described a method for hacking a standard inkjet printer, loading ink cartridges with a cell-suspension “bioink,” and printing lines of live cells onto glass slides. The thermal inkjet printing process creates temporary pores in the cell membrane, visualized by the incorporation of fluorescently labeled actin monomers. This concept, called “bioprinting,” has many potential applications in cell and tissue engineering.

Also in 2012, JoVE Bioengineering featured a protocol by Hsia et al. for isolating and purifying spider silk protein, spinning it into fibers, and assessing the fiber strength. This protocol for laboratory-scale production of spider silk, which is stronger than tensile steel, can potentially be extended to large-scale manufacturing.

In JoVE Clinical and Translational Medicine, we featured a number of articles related to stroke, one of which. In one article, Möbius-Winkler et al. demonstrated placement of the WATCHMAN left atrial appendage occlusion device from Boston Scientific. This device is designed to prevent strokes by trapping clots within the left atrial appendage of the heart before they exit. Our authors demonstrated how to insert the guide wire through the femoral artery into the heart, advance the device into the left atrium, and deploy the device in the left atrial appendage.

Another article focused on stroke, Hamel et al. described the use of a driving simulator to study how patients compensate for visual field defects following stroke. By analyzing the compensatory gaze behavior of patients as they navigated through virtual driving courses with varying degrees of complexity, our authors see great potential for the use of driving simulators in stroke rehabilitation.

In JoVE Immunology and Infection, we published an article by Keyel et al. describing the real-time kinetics of immune cell responses to bacterial toxins using live cell microscopy. Combined with high-speed 3D confocal microscopy, this technique can also visualize the cellular repair response.

Also in JoVE Immunology and Infection, we featured an article by Yap et al. describing methods for diagnosing helminth infections in children. Helminths are parasitic worms that can infect the intestinal tract of humans and animals, and may be distinguished based on their morphology. The same article demonstrated how to measure the impact of helminth infections on physical fitness in children, which is a measure of overall health.

In JoVE Neuroscience, we featured a method by Hoffmann et al., who used tiny headphones to alter the auditory feedback in songbirds, and analyzed the computational and neurophysiological basis of vocal learning in birds when they adjust their singing in response to altered acoustic signals.

Also in JoVE Neuroscience, we moved from birds to bees with a method that assesses associative and non-associative tactile learning in honeybees. This method, by Mujagić et al., allowed bees to scan different metal surfaces with their antennae, then conditioned them to expect sugar water when their antennae touched particular surfaces, and analyzed the corresponding changes in antennal movement.

In 2012, we launched a brand-new section: JoVE Applied Physics, which features articles on subjects ranging from plasma physics to material science. The Applied Physics section also contained JoVE’s 2000th video article, filmed in a synchrotron radiation facility, where Borisenko et al. showed how to determine the electronic structure of complex materials using angle-resolved photoemission spectroscopy.

In the JoVE General section, we published an article by Artioli et al. demonstrating the use of a portable gas analyzer to measure oxygen consumption during complex exercise – such as judo. By analyzing oxygen consumption and collecting blood for measuring plasma lactate concentration, this method can determine the relative contributions of different energy systems to specific aspects of complex exercise.

Finally, JoVE followed Dolhi et al. to a permanently ice-covered saline lake in Antarctica. There, scientists drilled through the ice to study single-celled microorganisms called protists that live in the harsh conditions of Antarctica.

This Year in Review was just a brief glimpse of a few of over 600 video articles that JoVE offered in 2012. Browse the JoVE archives to see thousands of other videos, and stay tuned for what’s coming up this year in JoVE: The Journal of Visualized Experiments.

Protocol

Un protocolo para la detección y el borrado en fase gaseosa radicales libres del humo del cigarrillo Mainstream Largo Xi Yu 1, Boris G. Dzikovski 2, Jack H. Freed 3, 2 1 CDCF AOX-Lab, 2 National Center for Advanced Biomedical ESR Tecnología (ACERT), Departamento de Química y Biología Química, Universidad de Cornell, 3 ACERT Investigación, Centro Departamento de Química y Biología Química, Baker Laboratory, Universidad de Cornell Spin-atrapamiento espectroscopía ESR se utilizó para estudiar el efecto de la planta de antioxidantes licopeno, pycnogenol y extracto de semilla de uva en el barrido de fase de gas radicales libres en el humo del cigarrillo. El vigilante Izquierda dispositivo auricular Cierre Apéndice de la fibrilación auricular Sven Möbius Wi-nkler, Marco Sandri, Norman Mangner, Phillip Lurz, Ingo Dähnert, Gerhard Schuler Universidad de Leipzig Heart Center El vídeo que acompaña describe un procedimiento para la colocación percutánea de la orejuela auricular izquierda VIGILANTE (LAA) del dispositivo. El vigilante es un dispositivo de nitinol diseñado para ser implantado permanentemente en, o ligeramente distal a la abertura del apéndice auricular izquierdo (LAA) para atrapar coágulos de sangre antes de que salga de la LAA, prevención del accidente cerebrovascular tromboembólico. La determinación de la contribución de los sistemas de energía durante el ejercicio Guilherme G. Artioli 1, 2 Rômulo C. Bertuzzi, Hamilton Roschel 1, 3, Sandro Mendes H. 1, Antonio H. Lancha Jr. 1, Emerson Franchini 4 1 Laboratorio de Nutrición Aplicada de la Facultad de Educación Física y el Deporte, Universidad de Sao Paulo, 2 Grupo Aeróbico Performance Research, Escuela de Educación Física y el Deporte de la Universidad de Sao Paulo, 3 Laboratorio de Adaptaciones neuromusculares al entrenamiento de fuerza, la Escuela de Educación Física y el Deporte de la Universidad de Sao Paulo, 4 Artes Marciales y Deportes de Combate Grupo de Investigación de la Facultad de Educación Física y el Deporte de la Universidad de Sao Paulo Este protocolo permite a los investigadores se centraron en el ejercicio y ciencias del deporte de determinar la contribución relativa de tres diferentes sistemas energéticos para el gasto energético total durante una gran variedad de ejercicios. Establecimiento de cultivos de enriquecimiento microbianos eucariotas a partir de un lago antártico químicamente estratificado y evaluación del potencial de fijación de carbono Jenna M. Dolhi, Nicholas Ketchum, Raquel M. Morgan-Kiss Departamento de Microbiología, Miami UnIVERSIDAD Microbianos eucariotas son a la vez una fuente de carbono derivado de la fotosíntesis y las principales especies depredadoras en forma permanente lagos cubiertos de hielo antárticas. Este informe describe un enfoque de cultivo de enriquecimiento para aislar metabólicamente microbianos eucariotas versátiles del lago de la Antártida, Lake Bonney, y evalúa el potencial de fijación de carbono inorgánico usando un ensayo de radioisótopo para la ribulosa-1 ,5-bisphophate carboxilasa oxigenasa (RUBISCO) la actividad. Araña de seda sintética producción a escala de laboratorio Yang Hsia, Gnesa Eric, Pacheco Ryan, Kristin Kohler, Jeffery Felicia, Craig Vierra Departamento de Ciencias Biológicas de la Universidad del Pacífico A pesar de las excelentes propiedades mecánicas y bioquímicas de sedas de araña, este material no se puede cosechar en grandes cantidades por medios convencionales. Aquí descRibe una estrategia eficaz para hacer girar artificiales fibras de seda de araña, que es un proceso importante para los investigadores que estudian la producción de seda de araña y su uso como la próxima generación de biomateriales. La determinación de helmintos transmitidos por el suelo el estado de infección y estado físico de los niños en edad escolar Peiling Yap 1, 2, Thomas Fürst 1, 2, Ivan Müller 1, 2, Susi Kriemler 1, 2, Jürg Utzinger 1, 2, Peter Steinmann 1, 2 1 Departamento de Epidemiología y Salud Pública, Swiss Tropical y Salud Pública, de Basilea, Suiza, 2 de la Universidad de Basel, Basilea, Suiza La infección crónica por helmintos transmitidos por el suelo (STHS) provoca malabsorción, retraso del crecimiento y la emaciación en el niño en crecimiento. Por lo tanto, es posible que estas infecciones también reducir los physical aptitud de los niños. A continuación, visualizamos dos técnicas para el diagnóstico de STHS y la prueba de lanzadera de 20 metros de largo para la evaluación de la aptitud física de los niños. Simulación de conducción en la clínica: Pruebas de Comportamiento Visual exploratoria en las Actividades de la vida diaria en pacientes con defectos del campo visual Johanna Hamel 1, 2, Antje Kraft 1, Sven Ohl 3, Sophie De Beukelaer 1, Heinrich J. Audebert 1, 2, Stephan A. Brandt 1 1 Departamento de Neurología, Universitätsmedizin Charité, 2 Centro de Investigación de Carrera de Berlín (CSB), Universitätsmedizin Charité, Berlín 3 Escuela de la Mente y el Cerebro, Humboldt Universität zu Berlin Los pacientes con déficit visual después del informe de golpe sobre diferentes limitaciones en la vida diaria muy probablemente debido a la variableestrategias de compensación, que son difíciles de diferenciar en la rutina clínica. Se presenta una clínica de configuración que permite la medición de la cabeza y diferentes compensatorio movimiento ocular-estrategias y evaluar sus efectos en la conducción. La visualización de las respuestas inducidas por toxinas bacterianas mediante microscopía de fluorescencia de células en vivo Peter A. Keyel 1, Michelle E. Heid 1, Simon C. Watkins 2, Russell D. Salter 1 1 Departamento de Inmunología de la Universidad de Pittsburgh School of Medicine, 2 Departamento de Biología Celular y Fisiología, Universidad de Pittsburgh School of Medicine Los métodos para purificar el colesterol unión toxina estreptolisina O de E. recombinante coli y la visualización de la toxina de la unión a vivir las células eucariotas se describen. Entrega localizada de la toxina induces rápidos y complejos cambios en las células específicas que revelan nuevos aspectos de la biología de la toxina. De ángulo resuelto espectroscopia de fotoemisión a bajas temperaturas Sergey V. Borisenko 1, Volodymyr B. Zabolotnyy 1, Alexander A. Kordyuk 1, 2, Danil V. Evtushinsky 1, Timur K. Kim 1, 3, 4 Emanuela Carleschi, Bryan P. Doyle 4, 5 Rosalba Fittipaldi, Mario Cuoco 5, Antonio Vecchione 5, Helmut Berger 6 1 Instituto de Investigación del Estado Sólido, IFW-Dresde, 2 Instituto de Física de metal de la Academia Nacional de Ciencias de Ucrania, 3 Diamond Light Source Ltd, 4 Departamento de Física de la Universidad de Johannesburgo, 5 CNR-SPIN, y Dipartimento di Fisica ER " Caianiello ", Università di Salerno, 6 Instituto deFísica de la Materia Complex, École Polytechnique Fédérale de Lausanne El objetivo general de este método es determinar la estructura electrónica de baja energía de los sólidos a bajas temperaturas utilizando Ángulo de resolverse la espectroscopia de fotoemisión con radiación sincrotrón. Un peso ligero, Auriculares basada Sistema de Manipulación de retroalimentación auditiva en Songbirds Lukas A. Hoffmann 1, 2, Conor W. Kelly 1, 3, David A. Nicholson 1, 2, Samuel J. Sober 1 1 Departamento de Biología de la Universidad de Emory, 2 Neurociencias Programa de Postgrado, Universidad de Emory, 3 Programa de Neurociencia y Biología del Comportamiento, Universidad de Emory Se describe el diseño y montaje de los auriculares miniaturizados adecuados para la sustitución de retroalimentación auditiva natural de un pájaro cantorcon una señal acústica manipulado. Online hardware de procesamiento de sonido se utiliza para manipular la salida canción, introducir en tiempo real de los errores en la retroalimentación auditiva a través de los auriculares, e impulsar el aprendizaje motor vocal. Aire táctil y Análisis de Movimiento de estrategias de muestreo antenales en las abejas melíferas (Apis mellifera L.) Samir Mujagic, Simon Michael Würth, Sven Hellbach, Volker Dürr Cibernética Biológica, CITEC – Tecnología – Cognitive Interaction Center of Excellence, Universidad de Bielefeld En este protocolo se muestra cómo acondicionar aprovechado las abejas a los estímulos táctiles e introducir una técnica de captura de movimiento 2D para analizar la cinemática de escala fina patrón de muestreo antenal.