Summary

הדמיה של רקמות ביולוגיות על ידי Desorption electrospray יינון המוני ספקטרומטריית

Published: July 12, 2013
doi:

Summary

Desorption electrospray יינון ספקטרומטריית מסה (דסי-MS) היא שיטה שבאמצעותו דגימות סביבה, כולל רקמות ביולוגיות, יכולות להיות צילמו עם הכנת מדגם מינימאלית. על ידי rastering המדגם מתחת לחללית היינון, טכניקה מבוססת ספריי זה מספקת רזולוציה מרחבית מספיק כדי להבחין במאפיינים מולקולריים של עניין בתוך סעיפי רקמות.

Abstract

ספקטרומטריית מסת הדמיה (MSI) מספקת מידע מולקולרי לא ממוקד עם סגוליות הגבוהה ביותר והרזולוציה מרחבית לחקירת רקמות ביולוגיות במאות עד עשרות מיקרונים קנה מידה. כאשר היא מבוצעת בתנאי הסביבה, מדגם טרום טיפול הופך להיות מיותר, ובכך לפשט את הפרוטוקול תוך השמירה על האיכות הגבוהה של מידע שהושג. יינון electrospray desorption (דסי) הוא טכניקת MSI סביבה מבוססת ספריי המאפשרת דגימה הישירה של משטחים באוויר הפתוח, גם in vivo. כאשר בשימוש עם תוכנת שלב דגימה מבוקרת, מדגם rastered מתחת לחללית יינון דסי, ודרך מישור הזמן, מידע מ '/ z הוא מתואם עם הפריסה המרחבית המינים כימיים ". נאמנותו של פלט דסי-MSI תלויה בנטיית המקור והמיצוב ביחס למדגם השטח וכניסת ספקטרומטר מסה. בזאת, אנו בודקים כיצד להכין סעיפי רקמות לדסי אניmaging ותנאי ניסוי נוספים שמשפיעים ישירות על איכות תמונה. באופן ספציפי, אנו מתארים את הפרוטוקול להדמיה של חלקי רקמות מוח חולדה על ידי דסי-MSI.

Introduction

הדמיה לא ממוקדת על ידי ספקטרומטריית מסה מאפשרת רכישת המידע כימי ליישומי גילוי והשערה מניבים. הדמיה ממוקדת של חומר כימי בשמו של עניין, ומצד שני, יכולה להקל על רגישות וסלקטיביות מוגברת באמצעות פיתוח שיטה ספציפי. ספקטרומטריית מסת הדמיה (MSI) מתבצעת לרוב על רקמות באמצעות טכניקות יינון סביבה, כוללים יינון desorption electrospray (דסי), 3 יינון אבלציה-electrospray לייזר (LAESI), 4, MALDI, יון משנית 1 ספקטרומטריית מסה (SIMS), 2 ו 5 ונוזל מייקר צומת משטח דגימת בדיקה (LMJ-SSP). 6 בMALDI וסימס, יש דוגמאות להסרה פיזית מהדגימה, וצריכה להיות שטוחה ודק, כפי שהם ניתחו תחת ואקום גבוה. MALDI דורש ציפוי של המדגם עם ספיגת קרינת מטריצה, והוסיף נדבך נוסף ומסורבל להכנת המדגם. SIMSיש לו את הרזולוציה לרוחב הגבוהה ביותר, אך הפגזה עם חלקיקים אנרגטיים ביותר גורמת לפיצול מולקולרי נרחב. לכן, על ידי שיטות MSI הסביבה למלא נישה שבה ניתוח רך עם הכנת מדגם מינימאלית רצוי. עם זאת, נכון להיום, כל השיטות עדיין מוגבלות על ידי הדרישה של משטחי מדגם שטוחים.

דסי משתמש בספריי ממס פניאומטית בסיוע מחויב כלפי שטח המדגם לdesorb ויינן analytes. 7 מודל העבודה לdesorption ויינון לאחר מכן על ידי דסי שמכונה "טיפת מודל איסוף". 8-10 הטיפין העיקריות המופקדות הופק על ידי חללית דסי מתנגש עם פני השטח, להרטיב אותו ויוצר סרט דק שלתוכו אנליטי הוא מומס על ידי מנגנון microextraction מוצק נוזל תוצאת 8 לאחר התנגשויות טיפה בהעברת מומנטום והמראה של טיפות משניים המכילות את החומר המופק מהמשטח . 9,10 סופו של דבר, גזיוני שלב הם האמינו להיות מיוצרים באמצעות תהליכים כמו 'חדשות ארכיאולוגיות בעקבות אידוי יון, מודלים שאריות חיוב או דגמים אחרים, 11 לעומת זאת את תהליך היווצרות יון המדויק בדסי טרם יהיה בניסוי מוכח. רגישות דסי 12 היא מאוד תלויה במסיסות של אנליטי בתרסיס הממס, כdesorption מסתמך על microextraction המקומי. 13

כאשר בשימוש עם תוכנת שלב דגימה מבוקרת, המדגם נסרק unidirectionally עם נתיב קפיצה מתחת לחללית יינון דסי, ודרך מישור הזמן, מידע מ '/ z הוא מתואם עם הפריסה המרחבית המינים כימיים' (איור 1). מאז את ההוכחה הראשונה של ניסוי דסי-MSI עיקרון שדווח על ידי ואן Berkel וקרטס בשנת 2006, 14 הטכניקה התבגרה במידה ניכרת, 15 עם יישומים שדווחו בניתוח של שומנים, 3,16 מטבוליטים סמים, 17,18 diseaסמנים ביולוגיים SE, רקמות, רקמות מוח 19 3,18,20 ריאות, רקמת הכליה 18, רקמת אשך 18, 18 בלוטת יותרת הכליה, 17 צלחות כרומטוגרפיה שכבה דקות, 21 ומשטחי אצות. 22 הרזולוציה השגרתית של תמונות שהושגו על ידי דסי-MSI הוא 100-200 מיקרומטר, אשר נקבע על ידי סופו של דבר את שטח הפנים היעיל שחולצו על ידי ספריי, אבל רזולוציות נמוכות כמו 40 מיקרומטר כבר דיווחה. החלטה כזו 23-25 ​​והקלות של ניתוח הופכת דסי-MSI המתאים לניתוח המהיר ופשוט של דגימות רקמה ביולוגיות עם שטח פנים בטווח 0.5-5 ס"מ 2, המאפשר הרכישה של מידע מרחבי רב ערך כדי להבין טוב יותר את התהליכים ביולוגיים 26. כאן, כדוגמה ליישום דסי-MSI טיפוסי, אנו בודקים את הפרטים פרוצדורליים של ניהול ניסוי מוצלח הכולל הדמיה של שומנים ברקמות מוח חולדה. את שני שלבים הקריטיים ביותר בפרוטוקול הםהכנת 27 ודסי אופטימיזציה מקור יון רקמות, כפי שיתואר להלן.

Protocol

1. רקמת חתך חנות רקמות פלאש קפוא, כולו במקפיא -80 ° C עד מוכן לחתך. לאפשר דגימת הרקמה כדי להגיע לטמפרטורה בcryomicrotome לפני חתך (30 דקות). הגדר את הלהב וטמפרטורת מדגם ל-30 ° C. ?…

Representative Results

איור 3 מציג ספקטרום נציג המתקבל מסעיף מוח חולדה שלא טופל. במצב החיובי, הספקטרום ההמוני הוא נשלט על ידי phosphatidylcholines בשל היעילות גבוהה שלהם היינון (מיוחסת לקבוצת אמוניום רבעוני הטעונה חיובי). תמונת יון הכוללת של קטע הרקמה היא גם מוצגת באיור 3, מראה אות ב?…

Discussion

אופטימיזציה של הגיאומטריה מקור דסי היא קריטית עבור ניסויי MSI מוצלחים. המשתנים מרובים תורמים ליישור של מערכת משפיעים ישירות על רגישות ורזולוציה של תמונה. אם במהלך חיפוש, יש לו את הקשיים בקבלת אות הנסיין, מומלץ להשתמש בנקודת טוש אדומה מצוירת על השקופית כאמת מידה; הצבע, r…

Divulgazioni

The authors have nothing to disclose.

Acknowledgements

עבודה זו נתמכת על ידי מכשיר MRI ערה NSF מענק פיתוח # 0923179 לFMF. אנו מודים אקווה Asberry, רכזת מעבדה לח' פטי מכון פארקר Bioengineering וBiosciences היסטולוגיה הליבה, לקבלת סיוע בחתך רקמה.

Materials

Reagents
Tissue-Tek O.C.T. Compound Sakura-Finetek 4583 http://www.sakuraeu.com/products/showitem.asp?cat=11&subcat=48
Acetonitrile EMD AX0156-6 OmniSolv, LC-MS Grade
Acetic Acid Sigma Aldrich 695092-500 ml
Equipment
Cryostat microtome Thermo Scientific CryoStar* NX70 Any available microtome can be used for tissue sectioning http://www.thermoscientific.com/ecomm/servlet/productsdetail?productId=13958375&groupType=PRODUCT&searchType=0&storeId=11152&from=search&ca=cryostar
Omni Spray;DESI Spray Head Prosolia Inc. Can also use the 2-D Omni Spray; Source kit instead of assembling components of imaging experiment http://www.prosolia.com/sources.php
High Voltage Power Supply Stanford Research Systems, Inc. PS350/5000V-25W http://www.thinksrs.com/products/PS300.htm
Rope heater, RTD, controller Omega http://www.omega.com/toc_asp/subsectionSC.asp?subsection=M02&book=Heaters
Labview National Instruments Version 7.1
Translational stage Prior Scientific Optiscan II http://www.prior.com/productinfo_auto_motorized_optiscan.html
AccuTOF Mass Spectrometer JEOL JMS-T100LC Can use any mass spectrometer equipped with an extended capillary atmospheric pressure interface

Riferimenti

  1. Caprioli, R. M., Farmer, T. B., Gile, J. Molecular Imaging of Biological Samples: Localization of Peptides and Proteins Using MALDI-TOF MS. Anal. Chem. 69, 4751-4760 (1997).
  2. Pacholski, M. L., Winograd, N. Imaging with Mass Spectrometry. Chem. Rev. 99, 2977-3006 (1999).
  3. Wiseman, J. M., Ifa, D. R., Song, Q., Cooks, R. G. Tissue Imaging at Atmospheric Pressure Using Desorption Electrospray Ionization (DESI) Mass Spectrometry. Angew. Chem. Int. Ed. 45, 7188-7192 (2006).
  4. Nemes, P., Laser Vertes, A. Laser Ablation Electrospray Ionization for Atmospheric Pressure, in Vivo, and Imaging Mass Spectrometry. Anal. Chem. 79, 8098-8106 (2007).
  5. Nemes, P., Vertes, A. Atmospheric-pressure Molecular Imaging of Biological Tissues and Biofilms by LAESI Mass Spectrometry. J. Vis. Exp. (43), e2097 (2010).
  6. Van Berkel, G. J., Kertesz, V., Koeplinger, K. A., Vavrek, M., Kong, A. -. N. T. Liquid microjunction surface sampling probe electrospray mass spectrometry for detection of drugs and metabolites in thin tissue sections. J. Mass Spectrom. 43, 500-508 (2008).
  7. Takáts, Z., Wiseman, J. M., Gologan, B., Cooks, R. G. Mass Spectrometry Sampling Under Ambient Conditions with Desorption Electrospray Ionization. Science. 306, 471-473 (2004).
  8. Venter, A., Sojka, P. E., Cooks, R. G. Droplet Dynamics and Ionization Mechanisms in Desorption Electrospray Ionization Mass Spectrometry. Anal. Chem. 78, 8549-8555 (2006).
  9. Costa, A. B., Cooks, R. G. Simulation of atmospheric transport and droplet-thin film collisions in desorption electrospray ionization. Chem. Commun. , 3915-3917 (2007).
  10. Costa, A. B., Graham Cooks, R. Simulated splashes: Elucidating the mechanism of desorption electrospray ionization mass spectrometry. Chem. Phys. Lett. 464, 1-8 (2008).
  11. Konermann, L., Ahadi, E., Rodriguez, A. D., Vahidi, S. Unraveling the Mechanism of Electrospray Ionization. Anal. Chem. 85, 2-9 (2012).
  12. Kebarle, P., Verkerk, U. H. Electrospray: From ions in solution to ions in the gas phase, what we know now. Mass Spectrom. Rev. 28, 898-917 (2009).
  13. Green, F. M., Salter, T. L., Gilmore, I. S., Stokes, P., O’Connor, G. The effect of electrospray solvent composition on desorption electrospray ionisation (DESI) efficiency and spatial resolution. Analyst. 135, 731-737 (2010).
  14. Van Berkel, G. J., Kertesz, V. Automated Sampling and Imaging of Analytes Separated on Thin-Layer Chromatography Plates Using Desorption Electrospray Ionization Mass Spectrometry. Anal. Chem. 78, 4938-4944 (2006).
  15. Ifa, D. R., Wu, C., Ouyang, Z., Cooks, R. G. Desorption electrospray ionization and other ambient ionization methods: current progress and preview. Analyst. 135, 669-681 (2010).
  16. Eberlin, L. S., Ferreira, C. R., Dill, A. L., Ifa, D. R., Cooks, R. G. Desorption electrospray ionization mass spectrometry for lipid characterization and biological tissue imaging. Biochim. Biophys. Acta. 1811, 946-960 (2011).
  17. Wu, C., Ifa, D. R., Manicke, N. E., Cooks, R. G. Molecular imaging of adrenal gland by desorption electrospray ionization mass spectrometry. Analyst. 135, 28-32 (2010).
  18. Wiseman, J. M., et al. Desorption electrospray ionization mass spectrometry: Imaging drugs and metabolites in tissues. Proc. Natl. Acad. Sci. 105, 18120-18125 (2008).
  19. Eberlin, L. S., et al. Classifying Human Brain Tumors by Lipid Imaging with Mass Spectrometry. Cancer Res. 72, 645-654 (2012).
  20. Wiseman, J. M., Ifa, D. R., Venter, A., Cooks, R. G. Ambient molecular imaging by desorption electrospray ionization mass spectrometry. Nat. Protocols. 3, 517-524 (2008).
  21. Van Berkel, G. J., Ford, M. J., Deibel, M. A. Thin-Layer Chromatography and Mass Spectrometry Coupled Using Desorption Electrospray Ionization. Anal. Chem. 77, 1207-1215 (2005).
  22. Lane, A. L., et al. Desorption electrospray ionization mass spectrometry reveals surface-mediated antifungal chemical defense of a tropical seaweed. Proc. Natl. Acad. Sci. 106, 7314-7319 (2009).
  23. Kertesz, V., Van Berkel, G. J. Scanning and Surface Alignment Considerations in Chemical Imaging with Desorption Electrospray Mass Spectrometry. Anal. Chem. 80, 1027-1032 (2008).
  24. Kertesz, V., Van Berkel, G. J. Improved imaging resolution in desorption electrospray ionization mass spectrometry. Rapid Commun. Mass Spectrom. 22, 2639-2644 (2008).
  25. Campbell, D., Ferreira, C., Eberlin, L., Cooks, R. Improved spatial resolution in the imaging of biological tissue using desorption electrospray ionization. Anal. Bioanal. Chem. 404, 389-398 (2012).
  26. Chaurand, P., Cornett, D. S., Angel, P. M., Caprioli, R. M. From Whole-body Sections Down to Cellular Level, Multiscale Imaging of Phospholipids by MALDI Mass Spectrometry. Mol. Cell. Proteomics. 10, (2011).
  27. Dill, A., Eberlin, L., Costa, A., Ifa, D., Cooks, R. Data quality in tissue analysis using desorption electrospray ionization. Anal. Bioanal. Chem. 401, 1949-1961 (2011).
  28. Jackson, S. N., Wang, H. -. Y. J., Woods, A. S. Direct Profiling of Lipid Distribution in Brain Tissue Using MALDI-TOFMS. Anal. Chem. 77, 4523-4527 (2005).
  29. Jackson, S. N., et al. MALDI-ion mobility-TOFMS imaging of lipids in rat brain tissue. J. Mass Spectrom. 42, 1093-1098 (2007).
  30. Wang, H. -. Y. J., Post, S. N. J. J., Woods, A. S. A minimalist approach to MALDI imaging of glycerophospholipids and sphingolipids in rat brain sections. Int. J. Mass Spectrom. 278, 143-149 (2008).
  31. Wu, B., Becker, J. S. Imaging of elements and molecules in biological tissues and cells in the low-micrometer and nanometer range. Int. J. Mass Spectrom. 307, 112-122 (2011).
  32. Eberlin, L. S., Ifa, D. R., Wu, C., Cooks, R. G. Three-Dimensional Vizualization of Mouse Brain by Lipid Analysis Using Ambient Ionization Mass Spectrometry. Angew. Chem. Int. Ed. 49, 873-876 (2010).
  33. Seeley, E. H., Caprioli, R. M. 3D Imaging by Mass Spectrometry: A New Frontier. Anal. Chem. 84, 2105-2110 (2012).
  34. Nemes, P., Barton, A. A., Vertes, A. Three-Dimensional Imaging of Metabolites in Tissues under Ambient Conditions by Laser Ablation Electrospray Ionization Mass Spectrometry. Anal. Chem. 81, 6668-6675 (2009).
  35. Pulfer, M., Murphy, R. C. Electrospray mass spectrometry of phospholipids. Mass Spectrom. Rev. 22, 332-364 (2003).
  36. Han, X., Holtzman, D. M., McKeel, D. W. Plasmalogen deficiency in early Alzheimer’s disease subjects and in animal models: molecular characterization using electrospray ionization mass spectrometry. J. Neurochem. 77, 1168-1180 (2001).
  37. Murphy, E. J., Schapiro, M. B., Rapoport, S. I., Shetty, H. U. Phospholipid composition and levels are altered in down syndrome brain. Brain Res. 867, 9-18 (2000).
  38. Han, X., et al. Alterations in Myocardial Cardiolipin Content and Composition Occur at the Very Earliest Stages of Diabetes: A Shotgun Lipidomics Study. Biochimica. 46, 6417-6428 (2007).
check_url/it/50575?article_type=t

Play Video

Citazione di questo articolo
Bennett, R. V., Gamage, C. M., Fernández, F. M. Imaging of Biological Tissues by Desorption Electrospray Ionization Mass Spectrometry. J. Vis. Exp. (77), e50575, doi:10.3791/50575 (2013).

View Video