Gli organi linfoidi secondari, compresi i linfonodi, sono composti da cellule stromali che forniscono un ambiente strutturale per l'omeostasi, l'attivazione e la differenziazione dei linfociti. Vari sottogruppi di cellule stromali sono stati identificati dall'espressione della molecola di adesione CD31 e della glicoproteina podoplanina (gp38), cellule reticolari della zona T o cellule reticolari fibroblastiche, cellule endoteliali linfatiche, cellule endoteliali del sangue e periciti FRC-simili all'interno della popolazione cellulare doppia negativa. Per tutte le popolazioni sono descritte diverse funzioni, tra cui la separazione e il rivestimento di diversi compartimenti, l'attrazione e l'interazione con diversi tipi di cellule, la filtrazione dei fluidi drenanti e la contrazione dei vasi linfatici. Negli ultimi anni, diversi gruppi hanno descritto un ruolo aggiuntivo delle cellule stromali nell'orchestrare e regolare le risposte citotossiche delle cellule T potenzialmente pericolose per l'ospite.
I linfonodi sono strutture complesse con molti tipi di cellule diverse e quindi richiedono una procedura appropriata per l'isolamento delle popolazioni cellulari desiderate. Attualmente, i protocolli per l'isolamento delle cellule stromali linfonodali si basano sulla digestione enzimatica con tempi di incubazione variabili; Tuttavia, le cellule stromali e le loro molecole di superficie sono sensibili a questi enzimi, il che provoca la perdita dell'espressione del marcatore di superficie e la morte cellulare. Qui viene proposto un breve protocollo di digestione enzimatica combinato con la disgregazione meccanica automatizzata per ottenere una sospensione vitale di singole cellule di cellule stromali linfonodali che mantengono la loro espressione molecolare di superficie.