Summary

Fysiologiske Recordings og RNA sekvensering av Gustatory vedheng av Yellow-feber Mosquito<em> Aedes aegypti</em

Published: December 30, 2014
doi:

Summary

Ved hjelp av to metoder for å anslå genuttrykk i de store smaks vedheng av Aedes aegypti, har vi identifisert et sett av gener putatively bak de nevrale responser til bitre og frastøtende forbindelser, som bestemmes av elektrofysiologisk undersøkelse.

Abstract

Electrophysiological recording of action potentials from sensory neurons of mosquitoes provides investigators a glimpse into the chemical perception of these disease vectors. We have recently identified a bitter sensing neuron in the labellum of female Aedes aegypti that responds to DEET and other repellents, as well as bitter quinine, through direct electrophysiological investigation. These gustatory receptor neuron responses prompted our sequencing of total mRNA from both male and female labella and tarsi samples to elucidate the putative chemoreception genes expressed in these contact chemoreception tissues. Samples of tarsi were divided into pro-, meso- and metathoracic subtypes for both sexes. We then validated our dataset by conducting qRT-PCR on the same tissue samples and used statistical methods to compare results between the two methods. Studies addressing molecular function may now target specific genes to determine those involved in repellent perception by mosquitoes. These receptor pathways may be used to screen novel repellents towards disruption of host-seeking behavior to curb the spread of harmful viruses.

Introduction

Forbindelser som DEET, Picaridin, citronellal og IR3535 har vist seg å effektivt frastøte mygg, inkludert viktig sykdom vektor Aedes aegypti 1,2. Vi registrerer aksjonspotensialer fra sensoriske nevroner forbundet med spesifikke gustatory sensilla å bestemme cellene som er involvert med myggavvisende. Sammen med nedstrøms sekvensering av uttrykte gener i disse vev, kan vi identifisere genene mest sannsynlig medier svarene av disse cellene for å screene nye forbindelser for forbedrede avvisende evner.

RNA-seq er et kraftig verktøy, raskt blitt standard for sporing tidsmessige og romlige endringer i genuttrykk. RNA-seq analyser av insekt chemosensory vedheng og organer har blitt brukt til å avdekke molekylære reseptorer i flere insektarter 3-5, mye bedre på konvensjonell PCR-basert søk genet ved genet 6. Insekter representerer den mest varierte dyre klasse, prerer mange muligheter til å studere sammenhengen mellom gener og unike fenotyper. RNA-seq teknologi kan brukes på en hvilken som helst levende insekt vev. På samme måte kan elektro opptak fra sensoriske celler i uniporous smaks- sensilla oppnås på mange forskjellige insektarter. Sammenkoblingen av disse to teknikkene tillater forskere å begrense de innstilte gener involvert i en observert chemosensory fenotype. Ulike arter vil presentere konkrete utfordringer, men kan informere sammenhengen mellom chemosensory reseptorgener og en chemosensory tilpasning. Størrelsen og morfologi chemosensory sensilla er variabel og kan kreve omfattende feilsøking ved opptak aksjonspotensialer for å redusere støy og identifisere repeterbare signaler. Dissections av chemosensory organer kan være ubetydelig eller delikat og tidkrevende, avhengig av morfologi og størrelse av insekt. Utvinning av høy kvalitet RNA kan kreve litt feilsøking også, slik som å unngå visse pigmenter undervev samling.

Mens demonstrere virkningene av fordrivende forbindelser gjennom adferdsforsøk er direkte og informativ, er denne tilnærmingen tidkrevende og bred med hensyn til virkningsmekanismen. Elektrofysiologi kombinert med RNA-seq åpner for mer spesifikke analyser av hva som driver unngåelsesatferd i insekter. Når "verktøykasse" kjemisk diskriminering er blitt identifisert i en insektarter, til mer spesifikke forsøk på å forbedre den kjente insektfordrivende midler er mulig. Reseptorer og tilhørende proteiner i sanseceller som er ansvarlige for disse atferd kan uttrykkes heterologt for direkte kjemisk screening. Videre kan molekylær modellering forutsi hvilke kjemikalier vil lokke fram sterke reaksjoner fra disse reseptorene 7.

Den øyeblikksbilde av alle aktive gener i et smalt sett av chemosensory vev kan også være nyttig for å identifisere tilsvarende gener i andre arter. Ved hjelp sekvenshomologi og uttrykk similarities, forskere kan danne sett av molekylære reseptorer mest sannsynlig medierende reaksjoner på insektmidler blir om lag effektive på insekter. Vi presenterer følgende protokoll for å hjelpe forskere i å dekonstruere insekt chemosensory stier og å overtale flere til å fordype deg i neuroethology av ikke-modellen og økonomisk viktige insekter.

Protocol

1. stell Ae. aegypti voksne Luke egg i ca ¾ tommers vann i grunne skuff. Overbefolkning vil redusere størrelsen på voksne. Bakre larver ved 25 ° C (12-HL: 12-HD) og mate med bakken fisk mat. MERK: fôring kan redusere overlevelse. Fjern puppe individuelt ved Pasteur pipette daglig og overføre til plast retter (9 cm x 5,5 cm) inne små containment bøtter med finmaskede lokk, og dermed etablere 24 timers aldersgrupperinger. Strøm voksne mygg 10% sukroseløsni…

Representative Results

Spor opptak av aksjonspotensialer fra Ae. aegypti smaks- sensilla (figur 1) viser effektiviteten av direkte stimulering med en rekke kjemikalier. Denne teknikken kan brukes til å kvantifisere reaksjoner på en hvilken som helst kjemisk stimulering ved telling av toppene av en gitt amplitude og varighet i løpet av et rimelig tidsrom (vanligvis mindre enn 500 ms). Spor opptak må være lett reproduserbar under et gitt sett av eksperimentelle betingelser. Ellers kan de observerte fysiologiske re…

Discussion

Den mest utfordrende delen av opptaket aksjonspotensialer fra gustatory sensilla er å avgjøre hvilke reaksjoner er "normal". Når ansette enkelt gustatory sensillum tips opptak første gang for en gitt insektarter, totalt antall og sensitiviteter av smaks reseptor nevroner (GRNs) er sannsynlig ukjent. Mange foreløpige opptak blir først nødvendig for å bestemme omfanget og konsentrasjoner av kjemikalier for å teste. I dette tilfellet starter vi med den observasjon at en enkelt grn svarte til lave konsent…

Divulgazioni

The authors have nothing to disclose.

Acknowledgements

The authors thank Bryan T. Vinyard of the USDA, Agricultural Research Service, Henry A. Wallace Beltsville Agricultural Research Center, Biometrical Consulting Service, Beltsville, MD for statistical analyses. This work was supported in part by a grant to J.C.D. from the Deployed War Fighter Protection (DWFP) Research Program funded by the Department of Defense through the Armed Forces Pest Management Board (AFPMB).

Materials

Name of Material/ Equipment Company Catalog Number Comments/Description
Glass capillary A-M Systems 628000 Standard, 1.5mm X 0.86mm, 4"
Silver wire A-M Systems 7875 .015" bare
Tungsten wire Alfa Products 369 0.127mm diameter
Fine forceps Fine Science Tools 11252 #5SF Inox
Refridgerated stage BioQuip Products 1429 Chill Table
Preamplifier Syntech Taste Probe preamplifier
Software for electrophysiology Syntech Autospike software for electrophysiology
TetraMin fish food Tetra Tropical fish food granules fish food ground to fine powder
TRIzol Life Technologies 15596-026 RNA isolation reagent
RNeasy Plus Mini Kit Qiagen 74136 includes gDNA eliminator and RNeasy spin columns
Nanodrop spectrophotometer Nano Drop Products ND-1000 tabletop spectrometer
R statistics freeware (created by Robert Gentleman and Ross Ihaka) www.r-project.org Use the lm function of the stats package and the equiv.boot function of the equivalence package in the R computing environment.
1.5ml tube rack Evergreen 240-6388-030 Pour liquid nitrogen into a few empty wells to freeze and grind tissue.
1.5mL collection tubes with pestle Grainger 6HAX6 RNase free
Centrifuge Thermo Scientific 11178160 Spin down frozen tissue to keep at bottom of 1.5 mL tube.
Primer-BLAST Primer Designing tool NCBI n/a

Riferimenti

  1. Klun, J. A., Khrimian, A., Debboun, M. Repellent and deterrent effects of SS220, picaridin, and DEET suppress human blood feeding by Aedes aegypti, Anopheles stephensi, and Phlebotomus papatasi. J. Med. Entomol. 43 (1), 34-39 (2006).
  2. Dickens, J. C., Bohbot, J. D. Mini review: Mode of action of mosquito repellents.Pestic. Biochem. Physiol. 106 (3), 149-155 (2013).
  3. Pitts, R. J., Rinker, D. C., Jones, P. L., Rokas, A., Zwiebel, L. J. Transcriptome profiling of chemosensory appendages in the malaria vector Anopheles gambiae reveals tissue- and sex-specific signatures of odor coding. BMC Genomics. 12 (271), (2011).
  4. Zhou, X., Slone, J. D., Rokas, A., Berger, S. L., Liebig, , et al. Phylogenetic and transcriptomic analysis of chemosensory receptors in a pair of divergent ant species reveals sex-specific signatures of odor coding. PLOS Genet. 8 (8), e1002930 (2012).
  5. Shiao, M., Fan, W., Fang, S., Lu, M. J., Kondo, R., Li, W. Transcriptional profiling of adult Drosophila antenna by high-throughput sequencing. Zoological Studies. 52 (42), (2013).
  6. Bohbot, J., Pitts, R. J., Kwon, H. W., Rützler, M., Robertson, H. M., Zwiebel, L. J. Molecular characterization of the Aedes aegypti odorant receptor gene family. Insect Mol. Biol. 16 (5), 525-537 (2007).
  7. Kain, P., Boyle, S. M., Tharadra, S. K., Guda, T., Pham, C., et al. Odour receptors and neurons for DEET and new insect repellents. Nature. 502 (7472), 507-512 (2013).
  8. Hodgson, E. S., Lettvin, J. Y., Roeder, K. D. The physiology of a primary chemoreceptor unit. Science. 122 (3166), 417-418 (1955).
  9. Robinson, A. P., Duursma, R. A., Marshall, J. D. A regression-based equivalence test for model validation: shifting the burden of proof. Tree Physiol. 25 (7), 903-913 (2005).
  10. Mortazavi, A., Williams, B. A., McCue, K., Schaeffer, L., Wold, B. Mapping and quantifying mammalian transcriptomes by RNA-seq. Nat. Methods. 5 (7), 621-628 (2008).
  11. Trapnell, C., Williams, B. A., Pertea, G., Mortazavi, A., Kwan, G., et al. Transcript assembly and quantification by RNA-seq reveals unannotated transcripts and isoform switching during cell differentiation. Nat. Biotechnol. 28 (5), 511-515 (2010).
  12. Sanford, J. L., Shields, V. D. C., Dickens, J. C. Gustatory receptor neuron responds to DEET and other insect repellents in the yellow-fever mosquito, Aedes aegypti. Naturwiss. 100 (3), 269-273 (2013).
  13. Sparks, J. T., Vinyard, B. T., Dickens, J. C. Gustatory receptor expression in the labella and tarsi of Aedes aegypti. Insect Biochem. Mol. Biol. 43 (12), 1161-1171 (2013).
  14. Kent, L. B., Walden, K. K. O., Robertson, H. M. The Gr family of candidate gustatory and olfactory receptors in the yellow-fever mosquito Aedes aegypti. Chem. Senses. 33 (1), 79-93 (2008).
  15. Ramsköld, D., Wang, E. T., Burge, C. B., Sandberg, R. An abundance of ubiquitously expressed genes revealed by tissue transcriptome sequence data. PLoS Comput. Biol. 5 (12), e1000598 (2009).
  16. Wagner, G. P., Kin, K., Lynch, V. J. A model based criterion for gene expression calls using RNA-seq data. Theory Biosci. 132 (3), 159-164 (2013).
  17. Hart, T., Komori, H. K., LaMere, S., Podshivalova, K., Salomon, D. D. Finding active genes in deep RNA-seq gene expression studies. BMC Genomics. 14 (778), (2013).
  18. Isono, K., Morita, H. Molecular and cellular designs of insect taste receptor system. Front. Cellu. Neurosci. 4 (20), 1-16 (2010).
check_url/it/52088?article_type=t

Play Video

Citazione di questo articolo
Sparks, J. T., Dickens, J. C. Physiological Recordings and RNA Sequencing of the Gustatory Appendages of the Yellow-fever Mosquito Aedes aegypti. J. Vis. Exp. (94), e52088, doi:10.3791/52088 (2014).

View Video