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Le tecniche di imaging in vivo sono aumentate nell'utilizzo a causa dei recenti progressi nei coloranti di imaging e nelle tecnologie ottiche, consentendo la capacità di visualizzare eventi cellulari in un animale intatto. Inoltre, la capacità di indurre stati patologici fisiologici come l'ictus in vivo ne aumenta l'utilità. La tecnica qui descritta consente la valutazione fisiologica delle risposte cellulari all'interno del SNC a seguito di un ictus e può essere adattata ad altre condizioni patologiche in fase di studio. La tecnica presentata utilizza l'eccitazione laser del colorante fotosensibile Rose Bengal in vivo per indurre un evento ischemico focale in un singolo vaso sanguigno.
Il protocollo video dimostra la preparazione di una finestra cranica sottile sopra la corteccia somatosensoriale in un topo per l'induzione di un evento fototrombotico di Rose Bengal, mantenendo al minimo il danno alla dura materia sottostante e al cervello. La preparazione chirurgica viene inizialmente eseguita sotto un microscopio da dissezione con una piattaforma chirurgica/di imaging su misura, che viene poi trasferita a un microscopio confocale dotato di un adattatore per obiettivo invertito. Vengono presentate immagini rappresentative acquisite utilizzando questo protocollo e sequenze time-lapse dell'induzione dell'ictus. Questa tecnica è potente in quanto la stessa area può essere visualizzata ripetutamente nei giorni successivi, facilitando gli studi longitudinali in vivo dei processi patologici successivi all'ictus.