Il rapido sviluppo di embrioni trasparenti di pesce zebra (Danio rerio) in combinazione con l'etichettatura fluorescente di cellule e tessuti permette di visualizzare i processi di sviluppo mentre avvengono nell'animale vivente. Le cellule di interesse possono essere marcate utilizzando un promotore tessuto-specifico per guidare l'espressione di una proteina fluorescente (FP) per la generazione di linee transgeniche. L'utilizzo di proteine fotoconvertibili fluorescenti per questo scopo consente inoltre di seguire con precisione strutture definite all'interno del dominio di espressione. Illuminando la proteina nella regione di interesse, cambia il suo spettro di emissione ed evidenzia una particolare cellula o ammasso cellulare lasciando altre cellule transgeniche nel loro colore originale. Una delle principali limitazioni è la mancanza di promotori noti per un gran numero di tessuti nel pesce zebra. Al contrario, gli screening di trappole geniche e enhancer hanno generato enormi risorse transgeniche etichettando discretamente letteralmente tutte le strutture embrionali per lo più con GFP o, in misura minore, FP rosse o gialle. Un approccio per seguire strutture definite in tali background transgenici sarebbe quello di introdurre anche una proteina fotoconvertibile ubiquitaria, che potrebbe essere convertita nella cellula o nelle cellule di interesse. Tuttavia, le proteine fotoconvertibili disponibili comportano uno stato di emissione verde e/o meno frequentemente uno stato di emissionerosso 1 e quindi spesso non possono essere utilizzate per tracciare le cellule nel fondo FP delle linee transgeniche esistenti. Per aggirare questo problema, abbiamo istituito il sistema PSmOrange per il pesce zebra2,3. Una semplice microiniezione di mRNA sintetico che codifica una forma nucleare di questa proteina marca tutti i nuclei cellulari con fluorescenza arancione/rossa. Dopo la fotoconversione mirata della proteina, cambia il suo spettro di emissione in rosso lontano. L'efficienza quantistica e la stabilità della proteina rendono PSmOrange un eccellente strumento di tracciamento cellulare per il pesce zebra e possibilmente per altre specie di teleostei.