Summary

Effektiv Sporulering av<em> Saccharomyces cerevisiae</em> I en 96 Multiwell Format

Published: September 17, 2016
doi:

Summary

Here, sporulation of Saccharomyces cerevisiae is carried out in a 96 multiwell format.

Abstract

During times of nutritional stress, Saccharomyces cerevisiae undergoes gametogenesis, known as sporulation. Diploid yeast cells that are starved for nitrogen and carbon will initiate the sporulation process. The process of sporulation includes meiosis followed by spore formation, where the haploid nuclei are packaged into environmentally resistant spores. We have developed methods for the efficient sporulation of budding yeast in 96 multiwell plates, to increase the throughput of screening yeast cells for sporulation phenotypes. These methods are compatible with screening with yeast containing plasmids requiring nutritional selection, when appropriate minimal media is used, or with screening yeast with genomic alterations, when a rich presporulation regimen is used. We find that for this method, aeration during sporulation is critical for spore formation, and have devised techniques to ensure sufficient aeration that are compatible with the 96 multiwell plate format. Although these methods do not achieve the typical ~80% level of sporulation that can be achieved in large-volume flask based experiments, these methods will reliably achieve about 50-60% level of sporulation in small-volume multiwell plates.

Introduction

Sporulering i knoppande jäst har studerats för att ge insikter i många aspekter av biologi, inklusive kontroll vid kromosomsegregation under meios en mekanismer för genetisk rekombination 2, kontroll av utvecklingen av cellsignalering 3, närings kontroll över utveckling 4, transkriptions reglering av utveckling 5, och granskningen av sporbildning 6. Sporbildning innehåller en helt ny celldelnings händelse som innebär bildandet av nya membran fack inom modercellen följt av avsättning av en skyddande spore väggen 6. Dessa studier som undersöker sporulerande celler drar ofta nytta av den snabbt sporbildande jäststammen SK1, som kan genomgå processen för sporulering i omkring 24 h i ett relativt effektivt sätt 7,8. Även optimering av sporulering villkoren för spirande jäst har beskrivits 9-13, dessa experiments undersökte sporulering på fasta medier eller i större skala flytande kulturer där sporulering utförs med hjälp av odlingsrör eller flaskor.

Här beskriver vi en metod för sporbildande jäst i en 96 flerkällsplatta format. Vi finner att för denna metod, är luftning kritisk för synkron och effektiv sporulering, och har tänkt ut tekniker för att säkerställa tillräcklig sporulering en liten volym flerkälls format. Sporbildande i en 96 flerkällsplatta format tillåter celler ses med hög genomströmning tekniker och reagens som är optimerade för en flerkällsplatta format, till exempel screening för höga kopieringsdämpare som använder ett kaklat bibliotek 14-16.

Protocol

1. Förberedelser för Sporulering Anm. Medierna beskrivs i detta protokoll görs med användning av standardrecept och metoder 13,17 Tabell 1 visar formuleringen för ett L av de olika medier som används i detta protokoll. B…

Representative Results

För att bedöma detta protokoll, var sporulering effektivitetsvinster från sporbildande celler i flerbrunnsplattor (som beskrivits ovan) jämfört med celler sporulerade användning av större volymer i flaskor (tabell 2). Användningen av flerbrunnsplattor inte uppnå hög effektivitet ses när sporbildande i flaskor, där ~ 80% verkningsgrad kan rutinmässigt sett. Sporbildande i flerbrunnsplattor med rätt luftning (som tillhandahålls av glaspärlor eller omr…

Discussion

Här presenterar vi ett protokoll för sporbildande SK1 jäst i en 96 multibrunn format. Luftning är nyckeln till effektiv sporulering, som kräver användning av antingen en omrörare eller en glaspärla i varje brunn. När cellerna sporbildning i en 96 flerkällsplatta i ett skakande inkubator utan antingen en kula eller en omrörare, gör cellerna inte sporer effektivt. Endast en liten ökning av sporbildning effektivitet ses när celler sporulerade utan antingen en kula eller en omrörare i en skakande inkubator, j…

Divulgazioni

The authors have nothing to disclose.

Acknowledgements

Detta arbete stöddes av en Joseph P. Healey bidrag från University of Massachusetts Boston (LSH) och R15 GM86805 från NIH (LSH). SMP stöds delvis av en Sanofi-Genzyme Fellowship vid University of Massachusetts Boston.

Materials

Nunc 1.3 ml DeepWell Plates ThermoScientific 260251 Used for sporulation
Nunc 2.0 ml DeepWell plates ThermoScientific 278743 Used for presporulation growth, step 1.2.3
3 mm glass bead Fisher 11-312A Used for sporulation
5 mm x 2 mm stir bar, pack of 12 Fisher 14-511-82 Used for sporulation
96 well frogger V&P Scientific VP407 needed for step 1.2
library copier V&P Scientific VP381 needed for step 1.2; to be used with the frogger
rectangular petri dish ThermoScientific 264728 needed for step 1.2
Bacto Peptone BD 211677 needed for media
Yeast Extract BD 212750 needed for media
Bacto Agar BD 212750 needed for media
Dextrose Fisher D16-3 needed for media
Potassium Acetate Fisher P171-500 needed for media
Glycerol Fisher G33-500 needed for media
Black 96 well glass bottom plate MatTek PBK96G-1.5.5-F needed for step 2.4

Riferimenti

  1. Marston, A. L. Chromosome segregation in budding yeast: sister chromatid cohesion and related mechanisms. Genetica. 196 (1), 31-63 (2014).
  2. Keeney, S., Lange, J., Mohibullah, N. Self-organization of meiotic recombination initiation: general principles and molecular pathways. Annu. Rev. Genet. 48, 187-214 (2014).
  3. Granek, J. A., Kayikci, O., Magwene, P. M. Pleiotropic signaling pathways orchestrate yeast development. Curr. Opin. Microbiol. 14 (6), 676-681 (2011).
  4. Broach, J. R. Nutritional control of growth and development in yeast. Genetica. 192 (1), 73-105 (2012).
  5. Winter, E. The Sum1/Ndt80 transcriptional switch and commitment to meiosis in Saccharomyces cerevisiae. Microbiol. Mol. Biol. Rev. 76 (1), 1-15 (2012).
  6. Neiman, A. M. Sporulation in the budding yeast Saccharomyces cerevisiae. Genetica. 189 (3), 737-765 (2011).
  7. Padmore, R., Cao, L., Kleckner, N. Temporal comparison of recombination and synaptonemal complex formation during meiosis in S. cerevisiae. Cell. 66 (6), 1239-1256 (1991).
  8. Liti, G., et al. Population genomics of domestic and wild yeasts. Nature. 458 (7236), 337-341 (2009).
  9. McCusker, J. H., Haber, J. E. Efficient sporulation of yeast in media buffered near pH6. J. Bacteriol. 132 (1), 180-185 (1977).
  10. Codon, A. C., Gasent-Ramirez, J. M., Benitez, T. Factors which affect the frequency of sporulation and tetrad formation in Saccharomyces cerevisiae baker’s yeasts. Appl. Environ. Microbiol. 61 (2), 630-638 (1995).
  11. Elrod, S. L., Chen, S. M., Schwartz, K., Shuster, E. O. Optimizing sporulation conditions for different Saccharomyces cerevisiae strain backgrounds. Methods Mol. Biol. 557, 21-26 (2009).
  12. Börner, G. V., Cha, R. S. Analysis of yeast sporulation efficiency, spore viability, and meiotic recombination on solid medium. Cold Spring Harb. Protoc. 2015 (11), 1003-1008 (2015).
  13. Börner, G. V., Cha, R. S. Induction and analysis of synchronous meiotic yeast cultures. Cold Spring Harb. Protocols. (10), 908-913 (2015).
  14. Jones, G. M., et al. A systematic library for comprehensive overexpression screens in Saccharomyces cerevisiae. Nat. Methods. 5 (3), 239-241 (2008).
  15. Fleming, M. S., Gitler, A. D. High-throughput yeast plasmid overexpession screen. J. Vis. Exp. (53), e2836 (2011).
  16. Paulissen, S. M., Slubowski, C. J., Roesner, J. M., Huang, L. S. Timely Closure of the Prospore Membrane Requires SPS1 and SPO77 in Saccharomyces cerevisiae. Genetica. , (2016).
  17. Amberg, D. C., Burke, D., Strathern, J. N. . Methods in Yeast Genetics: A Cold Spring Harbor Labooratory Manual. , (2005).
  18. Parodi, E. M., Baker, C. S., Tetzlaff, C., Villahermosa, S., Huang, L. S. SPO71 mediates prospore membrane size and maturation in Saccharomyces cerevisiae. Eukaryot. Cell. 11 (10), 1191-1200 (2012).
  19. Nakanishi, H., de Los Santos, P., Neiman, A. M. Positive and negative regulation of a SNARE protein by control of intracellular localization. Mol. Biol. Cell. 15 (4), 1802-1815 (2004).
  20. Huang, L. S., Doherty, H. K., Herskowitz, I. The Smk1p MAP kinase negatively regulates Gsc2p, a 1,3-beta-glucan synthase, during spore wall morphogenesis in Saccharomyces cerevisiae. Proc. Natl. Acad. Sci. USA. 102 (35), 13431-13436 (2005).
check_url/it/54584?article_type=t

Play Video

Citazione di questo articolo
Paulissen, S. M., Huang, L. S. Efficient Sporulation of Saccharomyces cerevisiae in a 96 Multiwell Format. J. Vis. Exp. (115), e54584, doi:10.3791/54584 (2016).

View Video